RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 OR8J2Q8NGG1 315 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 C16orf52Q8NHV5 167 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ASB15Q8WXK1 588 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 GAL3ST4Q96RP7 486 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 DUSP26Q9BV47 211 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 SLAMF7Q9NQ25 335 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 PLA2G3Q9NZ20 509 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PRB8 838 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 CAPN14A8MX76 684 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 B8ZZF3 427 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 CBX7O95931 251 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 CD46P15529 392 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 CD96P40200 585 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 IDH3AP50213 366 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 NRG3P56975 720 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 GUCY1A3Q02108 690 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 C19orf57Q0VDD7 668 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 INAQ16352 499 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ANXA8L1Q5VT79 327 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF843Q8N446 348 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5P2Q8WZ92 322 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 KAT2AQ92830 837 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM125Q96AQ2 219 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ELP4Q96EB1 424 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52B2Q96RD2 323 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 RASL10BQ96S79 203 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 C3orf14Q9HBI5 128 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 NEUROD4Q9HD90 331 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 LRFN1Q9P244 771 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR45Q9Y5Y3 372 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TTC36A6NLP5 189 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 A8MVJ9 347 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 WWP2O00308 870 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD28O15084 1053 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 LAMP1P11279 417 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 KIR3DL1P43629 444 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 CD97P48960 835 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC74AQ0VAA2 488 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 HSPB3Q12988 150 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 NADK2Q4G0N4 442 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2L13Q8N349 312 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 DOK4Q8TEW6 326 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 C5orf34Q96MH7 638 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 CLMPQ9H6B4 373 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 HPF1Q9NWY4 346 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ZIM2Q9NZV7 527 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 E9PBE3 544 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ACOX3O15254 700 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 MAN1A2O60476 641 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 VIMP08670 466 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 GPX3P22352 226 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TMED10P49755 219 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 STX1BP61266 288 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 OR1C1Q15619 314 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 PGS1Q32NB8 556 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 FHL5Q5TD97 284 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM107Q6UX40 140 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF441Q8N8Z8 693 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM178AQ8NBL3 297 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 OR7G2Q8NG99 324 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ADIPOR1Q96A54 375 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 HSPBAP1Q96EW2 488 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 SGCZQ96LD1 299 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 MFRPQ9BY79 579 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 BSNQ9UPA5 3926 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 KALRNO60229 2985 aa24.83■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 DRD5P21918 477 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SOX18P35713 384 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 MC3RP41968 323 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 PPICP45877 212 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 EMDP50402 254 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 PRR5P85299 388 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 MIER2Q8N344 545 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 MDS2Q8NDY4 140 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 PSMA8Q8TAA3 256 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 MOAP1Q96BY2 351 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 MRGBPQ9NV56 204 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM45AQ9NWC5 275 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 NTMQ9P121 344 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHGB4Q9UN71 923 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 ERVK-11Q9UQG0 969 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-212ENST00000508338 SUV39H1O43463 412 aa24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms