RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 EIPR1Q53HC9 387 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 KIF18BQ86Y91 864 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 OR4K14Q8NGD5 310 aa27.56■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 TUBAL3A6NHL2 446 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 OR7A17O14581 309 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 SOX18P35713 384 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 PLTPP55058 493 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 NRG3P56975 720 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 RPP38P78345 283 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 ZPLD1Q8TCW7 415 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 EPB41L4BQ9H329 900 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 CES1P1Q9UKY3 287 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 CAMK2AQ9UQM7 478 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 DTX4Q9Y2E6 619 aa27.55■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 CLDN9O95484 217 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 RAF1P04049 648 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 CPMP14384 443 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 OPRM1P35372 400 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 XKP51811 444 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 NAGLUP54802 743 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 MGAT2Q10469 447 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 TRADDQ15628 312 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 HGDQ93099 445 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 NTMT1Q9BV86 223 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF639Q9UID6 485 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 PPM1BO75688 479 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 ACTL6AO96019 429 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 CPN1P15169 458 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 PTGDSP41222 190 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 MASP1P48740 699 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 DGKQP52824 942 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 MAP4K2Q12851 820 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 DEFB113Q30KQ7 82 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 MROH9Q5TGP6 573 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 OR52B6Q8NGF0 335 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 UCN2Q96RP3 112 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 TRIB1Q96RU8 372 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 MED12LQ86YW9 2145 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 RHOXF2BP0C7M4 288 aa27.52■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 SNTA1Q13424 505 aa27.52■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa27.52■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 TECRLQ5HYJ1 363 aa27.52■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 PRR22Q8IZ63 422 aa27.52■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 C9orf106Q8NAJ2 232 aa27.52■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 TRPC4APQ8TEL6 797 aa27.52■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 CDK15Q96Q40 435 aa27.52■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
ALYREF-202ENST00000505490 A0A096LPK6 155 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 SNPHO15079 494 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 ATP1B1P05026 303 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 PORP16435 677 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 SLCO1A2P46721 670 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 FRG2Q64ET8 278 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 SLC30A6Q6NXT4 461 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 NUP54Q7Z3B4 507 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 METTL4Q8N3J2 472 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 OR1J4Q8NGS1 313 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 LINC01560Q8TB33 94 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 CTHRC1Q96CG8 243 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 FRG2BQ96QU4 278 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 ZBTB26Q9HCK0 441 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 HOXC12P31275 282 aa27.5■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 TRAF3Q13114 568 aa27.5■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 GGTA1PQ4G0N0 100 aa27.5■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 SLC48A1Q6P1K1 146 aa27.5■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC25Q86WR0 208 aa27.5■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 ZFP3Q96NJ6 502 aa27.5■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 NODALQ96S42 347 aa27.5■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 MAT2BQ9NZL9 334 aa27.5■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 CFL2Q9Y281 166 aa27.5■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa27.5■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 GNB5O14775 395 aa27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 KLK1P06870 262 aa27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 NT5EP21589 574 aa27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 C2orf54Q08AI8 447 aa27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 DESI1Q6ICB0 168 aa27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 KLC3Q6P597 504 aa27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 MMP21Q8N119 569 aa27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 VWA5B2Q8N398 1253 aa27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 OR2B2Q9GZK3 357 aa27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 PCTPQ9UKL6 214 aa27.49■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 CLCA1A8K7I4 914 aa27.48■■□□□ 1.99
ALYREF-202ENST00000505490 ACOX3O15254 700 aa27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms