RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ETV1	P50549	477 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MXD1	Q05195	221 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COMMD7	Q86VX2	200 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM129C	Q86XR2	697 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WDR34	Q96EX3	536 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DOHH	Q9BU89	302 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPR34	Q9UPC5	381 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SSX5	O60225	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PCMT1	P22061	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CD6	P30203	668 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPC1	P35052	558 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CDH12	P55289	794 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ITGA1	P56199	1179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VEZF1	Q14119	521 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RAB8B	Q92930	207 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FEV	Q99581	238 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF222	Q9UK12	451 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYO10	Q9HD67	2058 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PI15	O43692	258 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VEGFD	O43915	354 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLOD3	O60568	738 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRAMEF10	O60809	474 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPR37L1	O60883	481 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GSTM2	P28161	218 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PCGF2	P35227	344 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HSPB3	Q12988	150 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DUSP7	Q16829	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RAB23	Q9ULC3	237 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PCDHGA12	O60330	932 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SSTR2	P30874	369 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SELENOW	P63302	87 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MVK	Q03426	396 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IRF4	Q15306	451 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CTF1	Q16619	201 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PGBD3	Q8N328	593 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC5A8	Q8N695	610 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MENT	Q9BUN1	341 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HDAC8	Q9BY41	377 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TOR1A	O14656	332 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ALPPL2	P10696	532 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MASP1	P48740	699 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPIB	Q01892	262 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SHE	Q5VZ18	495 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C17orf64	Q86WR6	236 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LHX9	Q9NQ69	397 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A1W2PPV9	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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