RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 CD33P20138 364 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 ALAS2P22557 587 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 PAX7P23759 505 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 IMPA1P29218 277 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 TTKP33981 857 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 CAPGP40121 348 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 CASRP41180 1078 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 GABRA4P48169 554 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 ALDH3A2P51648 485 aa5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 MED27Q6P2C8 311 aa5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 OR10A6Q8NH74 314 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 FIG4Q92562 907 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 FAM162AQ96A26 154 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 WDR34Q96EX3 536 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 RNF145Q96MT1 663 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 SLC29A1Q99808 456 aa5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 MENTQ9BUN1 341 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 NLNQ9BYT8 704 aa5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 ATG10Q9H0Y0 220 aa5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 BTNL2Q9UIR0 455 aa5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 H3BMH7 237 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 ACOX3O15254 700 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 TPST1O60507 370 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 BMP10O95393 424 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 C1orf105O95561 183 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 STATHP02808 62 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 RAB40ALP0C0E4 278 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 COX7A2P14406 83 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 NCK1P16333 377 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 AGXTP21549 392 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 CXCR2P25025 360 aa5.88□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 HPCAL1P37235 193 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 UQCRFS1P47985 274 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 RAB28P51157 221 aa5.88□□□□□ -1.47
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MITF-215ENST00000478490 ESRRGP62508 458 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 TNP2Q05952 138 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 DOC2AQ14183 400 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 KIR2DS3Q14952 304 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 TTC23Q5W5X9 447 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 EPHX4Q8IUS5 362 aa5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
MITF-215ENST00000478490 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.88□□□□□ -1.47
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