RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 RGS1Q08116 209 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 USP43Q70EL4 1123 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 MFSD4AQ8N468 514 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM145Q8NBT3 493 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 OR1E3Q8WZA6 343 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 RSC1A1Q92681 617 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 GPR83Q9NYM4 423 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.5□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 PGRMC2O15173 223 aa11.5□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 EPPINO95925 133 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 AGR2O95994 175 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 SERPIND1P05546 499 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 FUT4P22083 530 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 CNR2P34972 360 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 VBP1P61758 197 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 ST3GAL4Q11206 333 aa11.5□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 ENTPD8Q5MY95 495 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 PLAG1Q6DJT9 500 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.5□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 LCN9Q8WX39 176 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.5□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 PHF11Q9UIL8 331 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 FAM221BA6H8Z2 402 aa11.49□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 MAN1A2O60476 641 aa11.49□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa11.49□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 LACC1Q8IV20 430 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 MORN4Q8NDC4 146 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 ELP4Q96EB1 424 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 MMP27Q9H306 513 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 RHCGQ9UBD6 479 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 AIREO43918 545 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 NADKO95544 446 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 STSP08842 583 aa11.49□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 MRGPREQ86SM8 312 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 ADCK1Q86TW2 530 aa11.49□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 SERINC2Q96SA4 455 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.49□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.48□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa11.48□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 POM121BA6NF01 834 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 ISM1B1AKI9 464 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 ZW10O43264 779 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 OR10H3O60404 316 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 PFDN1O60925 122 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 PRKAR1BP31321 381 aa11.48□□□□□ -0.57
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