RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 CTSKP43235 329 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 STT3AP46977 705 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CRISP1P54107 249 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 RELAQ04206 551 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SEC23BQ15437 767 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 COMTD1Q86VU5 262 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJC22Q8N4W6 341 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 MYDGFQ969H8 173 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 UCK2Q9BZX2 261 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 A4GNTQ9UNA3 340 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ZAR1LA6NP61 321 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CTSEP14091 401 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 GABRB1P18505 474 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CHMP24386 653 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ACVR2AP27037 513 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PSMB9P28065 219 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OR4N4Q8N0Y3 316 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FRMD1Q8N878 549 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OR4K14Q8NGD5 310 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PINK1Q9BXM7 581 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ACTRT3Q9BYD9 372 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 DAPP1Q9UN19 280 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 LIPT1Q9Y234 373 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 KCNE3Q9Y6H6 103 aa16.14■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 DSPPQ9NZW4 1301 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 A0A0J9YY10 115 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 H0YGG7 62 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 LGI1O95970 557 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PVRP15151 417 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 MAN2A2P49641 1150 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 XKP51811 444 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 UGT2B15P54855 530 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 RUNX2Q13950 521 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FZD2Q14332 565 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 HMGN2P46Q86SG4 172 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 BCL7BQ9BQE9 202 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CALML5Q9NZT1 146 aa16.13■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CLCA1A8K7I4 914 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 MBTPS2O43462 519 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 OSMP13725 252 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ALOX12P18054 663 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 LSSP48449 732 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 HPCAP84074 193 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SYT13Q7L8C5 426 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 RSC1A1Q92681 617 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 COL26A1Q96A83 441 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 GIMAP5Q96F15 307 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FUZQ9BT04 418 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FNDC11Q9BVV2 318 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 PRDM9Q9NQV7 894 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 GPR27Q9NS67 375 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FKBP14Q9NWM8 211 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 A0A1W2PRQ8 180 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 MPZL2O60487 215 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 GABARAPO95166 117 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 EPPINO95925 133 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SRFP11831 508 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 NR4A1P22736 598 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 POU1F1P28069 291 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 NUDT1P36639 197 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 BNIP3Q12983 259 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 DGCR6Q14129 220 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 CTF1Q16619 201 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM236Q5W0B7 351 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 RNF44Q7L0R7 432 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 C16orf62Q7Z3J2 963 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 SLC7A13Q8TCU3 470 aa16.12■□□□□ 0.17
FAAP20-211ENST00000469733 FCGR1BQ92637 280 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms