RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454704.5

GTF3C2-206, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GTF3C2, Length 1,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-206ENST00000454704 PARP16Q8N5Y8 322 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 OR52J3Q8NH60 311 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SLC38A5Q8WUX1 472 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 ARRDC3Q96B67 414 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SLC35G5Q96KT7 338 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 FUZQ9BT04 418 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 LINC00597Q9H2U6 94 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 ARMC7Q9H6L4 198 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 ABCB10Q9NRK6 738 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SEMA3GQ9NS98 782 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 CALML5Q9NZT1 146 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 REV1Q9UBZ9 1251 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 ACSL6Q9UKU0 697 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 WNT6Q9Y6F9 365 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SYT5O00445 386 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SNPHO15079 494 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 KMOO15229 486 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 NDUFS4O43181 175 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 TBX1O43435 398 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 KIAA0513O60268 411 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 UGT2B17O75795 530 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 RECKO95980 971 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 GASTP01350 101 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 IL1AP01583 271 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 BCHEP06276 602 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 NTSP30990 170 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 IFNA8P32881 189 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 RORCP51449 518 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 NUDT6P53370 316 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 CRISP3P54108 245 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 RUNX1T1Q06455 604 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SEC23BQ15437 767 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SPHARQ15513 63 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 MED22Q15528 200 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 BCL2A1Q16548 175 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 STEAP3Q658P3 488 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 OR5AK3PQ8NH89 298 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 COQ7Q99807 217 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SLC30A2Q9BRI3 323 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 MED18Q9BUE0 208 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 KLHL25Q9H0H3 589 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 OR51E2Q9H255 320 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 TMEM245Q9H330 911 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 OBP2AQ9NY56 170 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SSR3Q9UNL2 185 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 CACNA1GO43497 2377 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 A0A0G2JPF8 293 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 HYKKA2RU49 373 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 J3KTA2 159 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 ARHGAP33O14559 1287 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 MYL12BO14950 172 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 DYRK3O43781 588 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 OR10H3O60404 316 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 RAB36O95755 333 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 TNFRSF1BP20333 461 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 HOXA6P31267 233 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-206ENST00000454704 LIM2P55344 173 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms