RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 MID1IP1Q9NPA3 183 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 KCMF1Q9P0J7 381 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PHF11Q9UIL8 331 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ACAD8Q9UKU7 415 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 STK38LQ9Y2H1 464 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 L3MBTL1Q9Y468 752 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 HRH3Q9Y5N1 445 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZNF407Q9C0G0 2248 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 AKAP6Q13023 2319 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GLOD5A6NK44 160 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TMEM114B3SHH9 223 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 AQP7O14520 342 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ITM2AO43736 263 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TMPRSS11DO60235 418 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SUSD5O60279 629 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CTNSO60931 367 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SCELO95171 688 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 KRT6AP02538 564 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 KRT6BP04259 564 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 KLK1P06870 262 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 VIMP08670 466 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FAM58BPP0C7Q3 252 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NR2F6P10588 404 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GRK2P25098 689 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 BSGP35613 385 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SLC1A6P48664 564 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 KRT6CP48668 564 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF17Q02223 184 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 LCP2Q13094 533 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CEBPEQ15744 281 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 EMC4Q5J8M3 183 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 C18orf63Q68DL7 685 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 RTL4Q6ZR62 310 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 MDGA2Q7Z553 956 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GOLM1Q8NBJ4 401 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 OR2M7Q8NG81 312 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 METTL6Q8TCB7 284 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NCLNQ969V3 563 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 KCNA7Q96RP8 456 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZNF382Q96SR6 550 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TTTY12Q9BZ98 90 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GSTO2Q9H4Y5 243 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 LDAHQ9H6V9 325 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 WDR41Q9HAD4 459 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ADAP2Q9NPF8 381 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PNPLA3Q9NST1 481 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 MS4A12Q9NXJ0 267 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 AHSPQ9NZD4 102 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ATG4BQ9Y4P1 393 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TIMM22Q9Y584 194 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 A0A0A6YYD5 115 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HSPB2A8KAH6 182 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 FAM166BA8MTA8 275 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 FAM171A2A8MVW0 826 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 C17orf105B2RV13 164 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 MANBAO00462 879 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 KLF11O14901 512 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 FGF17O60258 216 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 OR10H2O60403 315 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 NPHS1O60500 1241 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HCN1O60741 890 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 GOSR1O95249 250 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HSPA4LO95757 839 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 IGHG3P01860 377 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 COX7A2P14406 83 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 MAN2A2P49641 1150 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HTR6P50406 440 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PKNOX1P55347 436 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP10.77□□□□□ -0.692e-46■□□□□ 9
PRAME-210ENST00000442481 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HSPB2Q16082 182 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 FBXW10Q5XX13 1052 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 OPN5Q6U736 354 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SCIMPQ6UWF3 145 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HSDL2Q6YN16 418 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PAGE2Q7Z2X7 111 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 BIVMQ86UB2 503 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 OR5L2Q8NGL0 311 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 OR6Y1Q8NGX8 325 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 DOK4Q8TEW6 326 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 MBD6Q96DN6 1003 aa10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms