RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442406.5

EIF4G1-222, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1, human

TSL 1 (best)

Gene EIF4G1, Length 5,129 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EIF4G1-222	ENST00000442406	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406		A0A1B0GVT2	93 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	PRKY	O43930	277 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	LCK	P06239	509 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	PHC1	P78364	1004 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZNF627	Q7L945	461 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC15A4	Q8N697	577 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	OR2L5	Q8NG80	312 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SGTB	Q96EQ0	304 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SERINC2	Q96SA4	455 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	GAL3ST1	Q99999	423 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	CD300A	Q9UGN4	299 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	CACNG3	O60359	315 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ALPL	P05186	524 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZNF691	Q5VV52	312 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	CCDC32	Q9BV29	185 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	LRRN3	E7EW58	273 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	TFAP2A	P05549	437 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	CRHBP	P24387	322 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	GPR4	P46093	362 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	APOO	Q9BUR5	198 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406		A8MU76	341 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	COQ8B	Q96D53	544 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	HCN2	Q9UL51	889 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	LAT	O43561	262 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	MAPK14	Q16539	360 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	TMEM165	Q9HC07	324 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	JUND	P17535	347 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	STOM	P27105	288 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	NSMAF	Q92636	917 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	RELT	Q969Z4	430 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406		A0A1W2PRG6	482 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	CA3	P07451	260 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	CD40LG	P29965	261 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	RABIF	P47224	123 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	C1orf61	Q13536	156 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	PTPRR	Q15256	657 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	SMPDL3B	Q92485	455 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	RFT1	Q96AA3	541 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	GPR174	Q9BXC1	333 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	CHIA	Q9BZP6	476 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	MED11	Q9P086	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406		M0R3H8	397 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	BMX	P51813	675 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ACTA2	P62736	377 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	ACTG2	P63267	376 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EIF4G1-222	ENST00000442406	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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