RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438929.5

BDNF-210, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,059 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-210ENST00000438929 CCDC36Q8IYA8 594 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 RDH10Q8IZV5 341 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 DBF4BQ8NFT6 615 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 OR8K3Q8NH51 312 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 CERS4Q9HA82 394 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 COPS3Q9UNS2 423 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PLCE1Q9P212 2302 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 LRRN3E7EW58 273 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 LGALS8O00214 317 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 CXCL11O14625 94 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PIP5K1CO60331 668 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 GPX2P18283 190 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 SOX9P48436 509 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 CCR6P51684 374 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 HBA1P69905 142 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PITPNAQ00169 270 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PLD1Q13393 1074 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ZNF79Q15937 498 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 RAB41Q5JT25 222 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 COX20Q5RI15 118 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 FAHD1Q6P587 224 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 SLC36A4Q6YBV0 504 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 UPRTQ96BW1 309 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PKMYT1Q99640 499 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PITX2Q99697 317 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 CLSTN3Q9BQT9 956 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 NTMT1Q9BV86 223 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 OR51I1Q9H343 314 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 LRRN3Q9H3W5 708 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 MTG2Q9H4K7 406 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 RASD1Q9Y272 281 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.85□□□□□ -1.47
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BDNF-210ENST00000438929 TAPBPO15533 448 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 LRRTM2O43300 516 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 B4GALT3O60512 393 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 SIX6O95475 246 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 URODP06132 367 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ALPPL2P10696 532 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PCGF2P35227 344 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 EPHA5P54756 1037 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 GPR176Q14439 515 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 OPCMLQ14982 345 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 RAET1GQ6H3X3 334 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 AGTRAPQ6RW13 159 aa5.85□□□□□ -1.47
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BDNF-210ENST00000438929 SLAIN1Q8ND83 568 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 FBXW5Q969U6 566 aa5.85□□□□□ -1.47
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BDNF-210ENST00000438929 DDOQ99489 341 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PTPN18Q99952 460 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 IFT27Q9BW83 186 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 REEP4Q9H6H4 257 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 THSD1Q9NS62 852 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 MARK1Q9P0L2 795 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 ACSL5Q9ULC5 683 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 GABRQQ9UN88 632 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-210ENST00000438929 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.85□□□□□ -1.47
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