RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC22O60826 627 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 SOD1P00441 154 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 GPR89BP0CG08 455 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 ICAM2P13598 275 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 CA4P22748 312 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 LHCGRP22888 699 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 FDFT1P37268 417 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 RGRP47804 291 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 KCNJ5P48544 419 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 NUP107P57740 925 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRK-211ENST00000429595 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 TWIST1Q15672 202 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC14Q49A88 953 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRK-211ENST00000429595 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRK-211ENST00000429595 LIPNQ5VXI9 398 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 ATG16L1Q676U5 607 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 STEAP4Q687X5 459 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 WASH2PQ6VEQ5 465 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFAF7Q7L592 441 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 LCA5Q86VQ0 697 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC6Q86X45 466 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 IZUMO1Q8IYV9 350 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 MARVELD2Q8N4S9 558 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 HORMAD2Q8N7B1 307 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO36Q8NEA4 188 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 JOSD2Q8TAC2 188 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 C10orf82Q8WW14 230 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 RXFP2Q8WXD0 754 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRK-211ENST00000429595 APOPT1Q96IL0 206 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 NSMCE3Q96MG7 304 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 PIP5K1AQ99755 562 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 CRB3Q9BUF7 120 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 BEX2Q9BXY8 128 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf21Q9H246 121 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 WDR54Q9H977 334 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRK-211ENST00000429595 ABCF3Q9NUQ8 709 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRK-211ENST00000429595 GTF3C1Q12789 2109 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GTH9 108 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 TUBAL3A6NHL2 446 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 FAM159BA6NKW6 160 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 SMIM23A6NLE4 172 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 A8MV72 311 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 F8W8V4 182 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 J3KR12 359 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 APOL1O14791 398 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 KCNJ13O60928 360 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 SOCS5O75159 536 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 T-ENOLP0DO92 83 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 TCF4P15884 667 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF24P17028 368 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 HLA-DPA1P20036 260 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 UGT1A1P22309 533 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 CALB2P22676 271 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRK-211ENST00000429595 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 DEFA6Q01524 100 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 CRYMQ14894 314 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 TMED2Q15363 201 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 SLC1A5Q15758 541 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 RPE65Q16518 533 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 C2CD6Q53TS8 623 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 AWAT1Q58HT5 328 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 ARMC12Q5T9G4 340 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC66Q68CR7 880 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-211ENST00000429595 OTOAQ7RTW8 1153 aa5.75□□□□□ -1.49
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