RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 FAM220BPB1ANY3 271 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ARPC2O15144 300 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 DLGAP3O95886 979 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ALBP02768 609 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ATP6V1B2P21281 511 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 SSTR4P31391 388 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 PGDP52209 483 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ACTR3P61158 418 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 MICU2Q8IYU8 434 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 OR56A1Q8NGH5 318 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 FKBP10Q96AY3 582 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 C14orf105Q9NVL8 296 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ZNF639Q9UID6 485 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 AP3M1Q9Y2T2 418 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 SDK2Q58EX2 2172 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 HMGN4O00479 90 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 FADDQ13158 208 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 SLC35G5Q96KT7 338 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 OR51I1Q9H343 314 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ADAP2Q9NPF8 381 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 A0A087WV62 115 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 PSMG1O95456 288 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 HEXBP07686 556 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 MATN1P21941 496 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 BNIP2Q12982 314 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ZNF321PQ8N8H1 164 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 MOAP1Q96BY2 351 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 C3orf18Q9UK00 162 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 KCNE3Q9Y6H6 103 aa21.71■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 C17orf105B2RV13 164 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 OR12D1P0DN82 309 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 TNNI3P19429 210 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 GGT1P19440 569 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 MAN2A2P49641 1150 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 VMACQ2NL98 169 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 TMEM164Q5U3C3 297 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 GLYATQ6IB77 296 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 DHFR2Q86XF0 187 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 SPPL2CQ8IUH8 684 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 FIG4Q92562 907 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 CNPPD1Q9BV87 410 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ACTR3BQ9P1U1 418 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 PADI1Q9ULC6 663 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 ERVK-19Q9WJR5 959 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 SNX13Q9Y5W8 968 aa21.7■■□□□ 1.07
CNN3-202ENST00000394202 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.7■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 BMP2P12643 396 aa21.7■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 SLC5A2P31639 672 aa21.7■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 MFSD12Q6NUT3 480 aa21.7■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 BHLHB9Q6PI77 547 aa21.7■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 GALNT10Q86SR1 603 aa21.7■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 SLC16A11Q8NCK7 471 aa21.7■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 OR52R1Q8NGF1 315 aa21.7■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 MS4A4EQ96PG1 132 aa21.7■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 SPTBN2O15020 2390 aa21.7■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 PTPRBP23467 1997 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 EMP2P54851 167 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 DSTNP60981 165 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 BIKQ13323 160 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 NCF4Q15080 339 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 MAPK11Q15759 364 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 GCNT6Q5T4J0 391 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 JADE3Q92613 823 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 CRB3Q9BUF7 120 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 RAD21L1Q9H4I0 556 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 WDR54Q9H977 334 aa21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 ALOX12BO75342 701 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 CLPSP04118 112 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 PRIM2P49643 509 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 GABREP78334 506 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 FUT7Q11130 342 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 SNCBQ16143 134 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 C6orf163Q5TEZ5 329 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 XAGE5Q8WWM1 108 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 SLC46A1Q96NT5 459 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 BCAP29Q9UHQ4 241 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 DTX4Q9Y2E6 619 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 C9J4A7 227 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 CXCR6O00574 342 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 GSTA4O15217 222 aa21.68■■□□□ 1.06
CNN3-202ENST00000394202 MGRN1O60291 552 aa21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms