RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 SCGNO76038 276 aa16.36■□□□□ 0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 MTNR1AP48039 350 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 CLDN2P57739 230 aa16.36■□□□□ 0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 CA14Q9ULX7 337 aa16.36■□□□□ 0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 DSC1Q08554 894 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 DPPA4Q7L190 304 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 THAP4Q8WY91 577 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2AT4A6NND4 320 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.218e-11■■□□□ 13.2
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SH3BP4-202ENST00000392011 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 NT5C3BQ969T7 300 aa16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PPL8 197 aa16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 AOAHP28039 575 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 MC3RP41968 323 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 GABARAPL2P60520 117 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 PRKCDQ05655 676 aa16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 OR52E2Q8NGJ4 325 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 ZIC5Q96T25 663 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC6A15Q9H2J7 730 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 VEZF1Q14119 521 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 STX12Q86Y82 276 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5D16Q8NGK9 328 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR20Q8TBZ3 569 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 PELI2Q9HAT8 420 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 CLCA1A8K7I4 914 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRN3E7EW58 273 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
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