RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365620.1

RNU6-597P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 597, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-597P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-597P-201ENST00000365620 CELF2O95319 508 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 SLC2A10O95528 541 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 ANP32DO95626 131 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 RETP07949 1114 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CSH1P0DML2 217 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CSH2P0DML3 217 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CD1BP29016 333 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 ACVR1BP36896 505 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 RPS9P46781 194 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 ROR1Q01973 937 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 SLC3A1Q07837 685 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 ACSM1Q08AH1 577 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 KCTD2Q14681 263 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 PRSS8Q16651 343 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 UGCGQ16739 394 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 ALFQ53S48 1182 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 MS4A13Q5J8X5 152 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 RABGAP1LQ5R372 815 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 HYIQ5T013 277 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 TAF3Q5VWG9 929 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 OR5M10Q6IEU7 315 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 MZT2BQ6NZ67 158 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 Q6ZS52 159 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 FRA10AC1Q70Z53 315 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 NEGR1Q7Z3B1 354 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CACUL1Q86Y37 369 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 TIGD4Q8IY51 512 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZNF709Q8N972 641 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 TC2NQ8N9U0 490 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CCDC197Q8NCU1 140 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 OR51G1Q8NGK1 321 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 SEPT8Q92599 483 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 MCHR2Q969V1 340 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 GUCD1Q96NT3 240 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 LRRC3BQ96PB8 259 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 MBOAT4Q96T53 435 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 FAM173AQ9BQD7 235 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 APOL6Q9BWW8 343 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 LRRC2Q9BYS8 371 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CARD9Q9H257 536 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 OR51J1Q9H342 316 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 MMP26Q9NRE1 261 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 ABCB8Q9NUT2 735 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 SNX7Q9UNH6 387 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 NID2Q14112 1375 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 TRBC2A0A5B9 178 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 NPIPA5E9PKD4 350 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 C11orf98E9PRG8 122 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 I3L1I5 382 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 J3QKU1 62 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 K7ERI5 159 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 M0R296 226 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 PES1O00541 588 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CFLARO15519 480 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 FLRT2O43155 660 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 RIPK2O43353 540 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 DOK2O60496 412 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CSO75390 466 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 TGDSO95455 350 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 INSP01308 110 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 IGHV3-9P01782 118 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 SEMG1P04279 462 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 GSTA1P08263 222 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 IGHV1-2P23083 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 SRD5A2P31213 254 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 CAPZA2P47755 286 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 NAGLUP54802 743 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 RPL27P61353 136 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 DCAF7P61962 342 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 BNIP1Q12981 228 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 GPR50Q13585 617 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 UNC50Q53HI1 259 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 C9orf152Q5JTZ5 239 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 FAM46CQ5VWP2 391 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 OR52W1Q6IF63 320 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 NANOGP8Q6NSW7 305 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 BTNL8Q6UX41 500 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 Q6ZRG5 221 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 DNM1P46Q6ZS02 220 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-597P-201ENST00000365620 RNF165Q6ZSG1 346 aa0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms