RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.78■□□□□ 0.28
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ACTB-201ENST00000331789 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 KRT73Q86Y46 540 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 TCTN2Q96GX1 697 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 NDUFA13Q9P0J0 144 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 NTMQ9P121 344 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 SEMA7AO75326 666 aa16.77■□□□□ 0.28
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ACTB-201ENST00000331789 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.77■□□□□ 0.28
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ACTB-201ENST00000331789 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa16.76■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 RAB38P57729 211 aa16.76■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 NPRL3Q12980 569 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 GNA13Q14344 377 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ZNF628Q5EBL2 1059 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 TCTN3Q6NUS6 607 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 MFSD12Q6NUT3 480 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 DEF8Q6ZN54 512 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 OR2L13Q8N349 312 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 SLC16A11Q8NCK7 471 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 MS4A4EQ96PG1 132 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 KLHL3Q9UH77 587 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 M0R3H8 397 aa16.76■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 CRHBPP24387 322 aa16.76■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 FNTBP49356 437 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 RPP38P78345 283 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 FHL5Q5TD97 284 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A45Q8N413 288 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS15Q8TE58 950 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 SGCDQ92629 289 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 TANKQ92844 425 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ZG16BQ96DA0 208 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 GIN1Q9NXP7 522 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 KCND3Q9UK17 655 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 CCNB2O95067 398 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 MYF5P13349 255 aa16.75■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 NT5EP21589 574 aa16.75■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 OR1D5P58170 312 aa16.75■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 C16orf62Q7Z3J2 963 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 FBLIM1Q8WUP2 373 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 SLC9A6Q92581 669 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 CDS1Q92903 461 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ALPK1Q96QP1 1244 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 RBCK1Q9BYM8 510 aa16.75■□□□□ 0.27
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