RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316436.3

LSMEM2-201, Transcript of leucine rich single-pass membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LSMEM2, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSMEM2-201ENST00000316436 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.79□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.79□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 A0A1W2PQ72 361 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SOCS6O14544 535 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PDE5AO76074 875 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 NUDT7P0C024 238 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 LIPCP11150 499 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 KCNJ2P63252 427 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 BIKQ13323 160 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PCOLCEQ15113 449 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PIGGQ5H8A4 983 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SZRD1Q7Z422 152 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 TRIML2Q8N7C3 387 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 RNF148Q8N7C7 305 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 NUP43Q8NFH3 380 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 FBXO30Q8TB52 745 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF721Q8TF20 911 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 FBXL20Q96IG2 436 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 CDRT15Q96T59 188 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 CD300AQ9UGN4 299 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 COX6A1P12074 109 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 GPX2P18283 190 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 MMP11P24347 488 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 MAN2A2P49641 1150 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 EMDP50402 254 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 RASSF2P50749 326 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 GPR143P51810 404 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 RGNQ15493 299 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 VASH2Q86V25 355 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 MOAP1Q96BY2 351 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF583Q96ND8 569 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 THTPAQ9BU02 230 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 NUDT9Q9BW91 350 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 GPR87Q9BY21 358 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 EQTNQ9NQ60 294 aa14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
LSMEM2-201ENST00000316436 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 TNFRSF21O75509 655 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 ETFAP13804 333 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 LIFP15018 202 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 GSK3BP49841 420 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 PRKAG1P54619 331 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC37A1P57057 533 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 RPS15P62841 145 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 PRR5P85299 388 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 LIPEQ05469 1076 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 VAC14Q08AM6 782 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 CLN3Q13286 438 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 ADRM1Q16186 407 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 PTOV1Q86YD1 416 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.76□□□□□ -0.05
LSMEM2-201ENST00000316436 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms