RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 PTGFRNQ9P2B2 879 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 KCND3Q9UK17 655 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 TMCC3Q9ULS5 477 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNE3Q9Y6H6 103 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM131Q92545 1883 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 LMO7DNF2Z398 122 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SGK494L7N484 410 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC1A7O00341 560 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 HCRTR1O43613 425 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SDC3O75056 442 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 ANGPTL1O95841 491 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 EPHA2P29317 976 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 LIMS1P48059 325 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 HPCAP84074 193 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 ID2Q02363 134 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR153Q6NV75 609 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM111BQ6SJ93 734 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM92BQ6ZTR7 304 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 CA13Q8N1Q1 262 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 OR9Q2Q8NGE9 314 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 FBLIM1Q8WUP2 373 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP3K3Q99759 626 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 RLIMQ9NVW2 624 aa22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 LDB3O75112 727 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 BCKDHBP21953 392 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 MAN2A2P49641 1150 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 NEDD8Q15843 81 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBED5Q49AG3 693 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 FGD3Q5JSP0 725 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 TANKQ92844 425 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 GIMAP5Q96F15 307 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 TCTN2Q96GX1 697 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 GUCD1Q96NT3 240 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 NTMQ9P121 344 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 ABCB7O75027 752 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 AGR2O95994 175 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC159P0C7I6 412 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 TCTN3Q6NUS6 607 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 MFSD12Q6NUT3 480 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 PITX2Q99697 317 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 CYR61O00622 381 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 FFAR1O14842 300 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 RDH16O75452 317 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR75O95800 540 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 TTKP33981 857 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 NUP107P57740 925 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SMIM11AP58511 58 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SKP1P63208 163 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2L13Q8N349 312 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 C1orf216Q8TAB5 229 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 NCSTNQ92542 709 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC9A6Q92581 669 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 HRASLS5Q96KN8 279 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 PSD2Q9BQI7 771 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 GIN1Q9NXP7 522 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1-201ENST00000007264 ARRDC5A6NEK1 342 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 FGF17O60258 216 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 H1F0P07305 194 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB38P57729 211 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM214AQ32MH5 1076 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 LAIR2Q6ISS4 152 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC73Q6P1J9 531 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 HMGN2P46Q86SG4 172 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 AQP11Q8NBQ7 271 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 OR9A4Q8NGU2 314 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF566Q969W8 418 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 SNX5Q9Y5X3 404 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 PTGES3LE9PB15 166 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 M0R3H8 397 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 NME6O75414 186 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 ALPPP05187 535 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 NT5EP21589 574 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 PMS2P3Q13401 168 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 NDUFA9Q16795 377 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms