RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ssxb1Q9CPU1 170 aa16.9■□□□□ 0.3
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MagohbQ9CQL1 146 aa16.9■□□□□ 0.3
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm595A2AF73 655 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zfp282E9PVC2 666 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Omt2aF6ZJR3 104 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sult3a2G5E904 293 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tuba3aP05214 450 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tmem120bQ3TA38 339 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pag1Q3U1F9 429 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Clca4bQ3UW98 925 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sel1l2Q3V172 688 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Klra8Q60682 266 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nr6a1Q64249 495 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cr1lQ64735 483 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fbxw13Q8BI57 466 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ifrd2Q9D8U0 441 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ift22Q9DAI2 185 aa16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mecp2Q9Z2D6 484 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Otud3B1AZ99 396 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Muc3E9PWP7 378 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rad51dO55230 329 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P01629 112 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P01809 118 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 ThpoP40226 356 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cd36Q08857 472 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cobll1Q3UMF0 1273 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Taar2Q5QD17 339 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Snrnp40Q6PE01 358 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 SergefQ80YD6 464 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 SybuQ8BHS8 665 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ugt2b35Q8BJL9 529 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Prmt5Q8CIG8 637 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Adam11Q9R1V4 773 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PtgfrnQ9WV91 879 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm11214V9GX06 183 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kiaa1549Q68FD9 1940 aa16.88■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Akap13E9Q394 2776 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 RerglB2RVE2 204 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Adamts3E9Q287 1204 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vmn2r52L7N2B2 852 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hcn1O88704 910 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 C2cd4dP0CG09 341 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kif2aP28740 705 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gli1P47806 1111 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PdxpP60487 292 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tmem173Q3TBT3 378 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zmat1Q3V0C1 714 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kctd8Q50H33 476 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Snx6Q6P8X1 406 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Abhd10Q6PE15 297 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nek5Q7TSC3 627 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr103Q920Y8 313 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fbxl20Q9CZV8 436 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kti12Q9D1R2 351 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tex29Q9DA77 186 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Uqcrc2Q9DB77 453 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Klhl1Q9JI74 751 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Il22Q9JJY9 179 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dkk3Q9QUN9 349 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Golga5Q9QYE6 729 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Spo11Q9WTK8 396 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gdf2Q9WV56 428 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trank1Q8BV79 2999 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pkd1l3Q2EG98 2201 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Osbpl8B9EJ86 889 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 GlsD3Z7P3 674 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vmn2r96E9PZU5 664 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zfp141G3UY09 685 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 C3ar1O09047 477 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ccrl2O35457 360 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nfkbil1O88995 381 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zp2P20239 713 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fam81aQ3UXZ6 364 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Arhgap44Q5SSM3 814 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rbl1Q64701 1063 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Znf366Q6NS86 746 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr293Q7TS10 336 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MtdhQ80WJ7 579 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rab38Q8QZZ8 211 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vmn1r24Q8R2D6 296 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Klhl25Q8R2P1 589 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slf1Q8R3P9 1054 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Akr1c21Q91WR5 323 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Psat1Q99K85 370 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Maf1Q9D0U6 258 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cysrt1Q9D1E4 142 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 4930412O13RikQ9D5M9 106 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Haus5Q9D786 619 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rtp4Q9ER80 249 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Prg4Q9JM99 1054 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Entpd5Q9WUZ9 427 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lrit3W8DXL4 681 aa16.87■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 AmacrO09174 381 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gstm2P15626 218 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tnfrsf1bP25119 474 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pxmp2P42925 194 aa16.86■□□□□ 0.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fgf1P61148 155 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.3 ms