RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PapolgQ6PCL9 739 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Osgepl1Q6PEB4 414 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cst13Q80ZN5 141 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r192Q8K4C9 300 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FbrsQ8R089 466 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ogfrl1Q8VE52 464 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asf1aQ9CQE6 204 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ift22Q9DAI2 185 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1508Q9R0K4 310 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sema4gQ9WUH7 837 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dpp6Q9Z218 804 aa15.28■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7929A0A286YDV3 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14744B1AVU4 173 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex264E9Q137 309 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21977F6U3N7 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm11397F6V5V4 377 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8247F6VRJ8 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8005F6YKY3 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3015F6ZAP6 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8212F6ZMY5 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7954F7BAX1 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8138F7BY56 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8232F7CFJ3 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17079F7D8Y4 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp871G5E905 615 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3755K7N743 167 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8165L7N218 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8122L7N2C7 213 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17078M0QW51 211 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TertO70372 1122 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adrb1P34971 466 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TtkP35761 856 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrps6P58064 125 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IgfalsP70389 603 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cxcl3Q6W5C0 100 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr845Q7TRG2 312 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bpifb2Q8C1E1 462 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxl3Q8C4V4 428 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt2b37Q8VCN3 530 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr166Q8VGX2 312 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpinb9gQ8VHQ1 377 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 5430402E10RikQ9D3N5 173 aa15.27■□□□□ 0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Auts2A0A087WPF7 1261 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajb3O35723 242 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Reps1O54916 795 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LipcP27656 510 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dsc1P55849 886 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fezf1Q0VDQ9 475 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C1orf109Q499E6 217 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ScocQ78YZ6 125 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eri1Q7TMF2 345 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas2r3Q7TQA7 316 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AspaQ8R3P0 312 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zmynd11Q8R5C8 602 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bbox1Q924Y0 387 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cstf1Q99LC2 431 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hspa14Q99M31 509 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm16286Q9CQX6 220 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Khdc3Q9CWU5 440 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Amdhd1Q9DBA8 426 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clec1bQ9JL99 229 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tinf2Q9QXG9 341 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nfkb2Q9WTK5 899 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dyrk1bQ9Z188 629 aa15.27■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MgllO35678 303 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alx3O70137 343 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tia1P52912 386 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lman2lP59481 347 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbx5P70326 518 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AktipQ64362 292 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpina3fQ80X76 445 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il23rQ8K4B4 644 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gipc3Q8R5M0 297 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EdaraddQ8VHX2 208 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hemk1Q921L7 340 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx20Q9D2Y5 313 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem37Q9JJV3 211 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lpar2Q9JL06 348 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plxna3P70208 1872 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Frem3Q5H8B9 2123 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cfap54Q8C6S9 3106 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 8030474K03RikE9Q4Y8 554 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21319F6YNI8 144 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pmp22P16646 161 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab42Q0PD08 215 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pnliprp1Q5BKQ4 473 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf503Q7TMA2 652 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr384Q7TRX8 312 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim50Q810I2 483 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mal2Q8BI08 175 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chmp1b1Q99LU0 199 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nkiras2Q9CR56 191 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NaaaQ9D7V9 362 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spata19Q9DAQ9 154 aa15.26■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tlr1Q9EPQ1 795 aa15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.6 ms