RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 GNRHR2Q96P88 292 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIB1Q96RU8 372 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR41Q9HAD4 459 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 JKAMPQ9P055 326 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 C15orf41Q9Y2V0 281 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PS29 197 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CLCA1A8K7I4 914 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 H0YIV9 168 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 UGDHO60701 494 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 IL18BPO95998 194 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CT62P0C5K7 136 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 BMP7P18075 431 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXC12P31275 282 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 OPRM1P35372 400 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CASP3P42574 277 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 NRG3P56975 720 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GPX6P59796 221 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RPP38P78345 283 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PHEXP78562 749 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 FUT7Q11130 342 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CUL3Q13618 768 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SLMAPQ14BN4 828 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 EIPR1Q53HC9 387 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF615Q8N8J6 731 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 C17orf47Q8NEP4 570 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 UCN3Q969E3 161 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 REPS1Q96D71 796 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ACTR8Q9H981 624 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CALHM2Q9HA72 323 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 MED12Q93074 2177 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SYCE1LA8MT33 242 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GNB5O14775 395 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PGRMC2O15173 223 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CDH16O75309 829 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GBAP04062 536 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 HRGP04196 525 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GSTA2P09210 222 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CD53P19397 219 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PIK3R1P27986 724 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCD3P28288 659 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPN6P29350 595 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CRABP2P29373 138 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 NAGLUP54802 743 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 DCAF7P61962 342 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 LTBQ06643 244 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CALCOCO2Q13137 446 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RCAN2Q14206 197 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SETDB1Q15047 1291 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TOMM20Q15388 145 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TIGD3Q6B0B8 471 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM81Q6P7N7 255 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDT13Q86X67 352 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR22Q8IZ63 422 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PPM1NQ8N819 430 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 NXNL1Q96CM4 212 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 C18orf12Q96KH6 178 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SMR3AQ99954 134 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10A5Q9H207 317 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 WHRNQ9P202 907 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 FETUBQ9UGM5 382 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PPR1 153 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC189A1A4V9 331 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 ERN1O75460 977 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-226ENST00000593200 SEMA3DO95025 777 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms