RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ADIPOR1Q96A54 375 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NXNL1Q96CM4 212 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 WDYHV1Q96HA8 205 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 H0YIV9 168 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PGRMC2O15173 223 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP3P42574 277 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PHEXP78562 749 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CUL3Q13618 768 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 KEAP1Q14145 624 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SETDB1Q15047 1291 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TOMM20Q15388 145 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PACS2Q86VP3 889 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF18BQ86Y91 864 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR22Q8IZ63 422 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1NQ8N819 430 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF615Q8N8J6 731 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NTNG2Q96CW9 530 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR41Q9HAD4 459 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 JKAMPQ9P055 326 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSSP25774 331 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TMED10P49755 219 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NEK2P51955 445 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SORDQ00796 357 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF9Q00978 393 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 FUT7Q11130 342 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52E8Q6IFG1 317 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT13Q86X67 352 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT12Q8IXK2 581 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf106Q8NAJ2 232 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD4Q8WVF5 259 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM41AQ96HV5 264 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SMR3AQ99954 134 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 GNB5O14775 395 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CRABP2P29373 138 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX18P35713 384 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PAFAH1B1P43034 410 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 GNG11P61952 73 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CALCOCO2Q13137 446 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.342e-10■■■■■ 40.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PFKFB4Q16877 469 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR20Q8TBZ3 569 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 REPS1Q96D71 796 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10A5Q9H207 317 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 GRHL1Q9NZI5 618 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 WHRNQ9P202 907 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 DNHD1Q96M86 4753 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS13CQ709C8 3753 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCA1A8K7I4 914 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 SYCE1LA8MT33 242 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTA2P09210 222 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN6P29350 595 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 OPRM1P35372 400 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3CGP48736 1102 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NAGLUP54802 743 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NRG3P56975 720 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 TIGD3Q6B0B8 471 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 ERP44Q9BS26 406 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 CALHM2Q9HA72 323 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 DTX4Q9Y2E6 619 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF11Q9Y3C5 154 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NINQ8N4C6 2090 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 NAV3Q8IVL0 2385 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-211ENST00000590874 UGDHO60701 494 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GFAPP14136 432 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3R1P27986 724 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCD3P28288 659 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXC12P31275 282 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO1A2P46721 670 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 POU4F3Q15319 338 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 DESI1Q6ICB0 168 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 Q71RC1 249 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 RHEBL1Q8TAI7 183 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 YIPF4Q9BSR8 244 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 IPPKQ9H8X2 491 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ACOT9Q9Y305 439 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPR1 153 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 IL18BPO95998 194 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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