RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590506.1

NEDD4L-229, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene NEDD4L, Length 2,743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-229	ENST00000590506	NIT2	Q9NQR4	276 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-229	ENST00000590506	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-229	ENST00000590506	FZD4	Q9ULV1	537 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-229	ENST00000590506	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-229	ENST00000590506	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	TAPBP	O15533	448 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SLC19A2	O60779	497 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	PAGE1	O75459	146 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	RAB36	O95755	333 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	TF	P02787	698 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	DRD2	P14416	443 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	INSRR	P14616	1297 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SDC1	P18827	310 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	HLA-DPA1	P20036	260 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	ITGB8	P26012	769 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CD79B	P40259	229 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	KIR3DL1	P43629	444 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SELENOW	P63302	87 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SP140	Q13342	867 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	TTLL4	Q14679	1199 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SGCA	Q16586	387 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	IFI44L	Q53G44	452 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506		Q6ZTK2	550 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	ARMCX2	Q7L311	632 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	TRPV1	Q8NER1	839 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	EGFL8	Q99944	293 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	EBPL	Q9BY08	206 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	ACER3	Q9NUN7	267 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	ASIC5	Q9NY37	505 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	NPTN	Q9Y639	398 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	LCT	P09848	1927 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	NIN	Q8N4C6	2090 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	PLSCR5	A0PG75	271 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	GSAP	A4D1B5	854 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CD8B2	A6NJW9	211 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506		H3BN98	237 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	GADD45G	O95257	159 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	PEX11B	O96011	259 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	PDYN	P01213	254 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	MT-ND4	P03905	459 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CD3G	P09693	182 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CD8B	P10966	210 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	HSD17B2	P37059	387 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	PRMT2	P55345	433 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	WNT4	P56705	351 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	VEZF1	Q14119	521 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SLC36A2	Q495M3	483 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	MARC1	Q5VT66	337 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CASP12	Q6UXS9	341 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	DEF8	Q6ZN54	512 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SIAH3	Q8IW03	269 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	MICALL2	Q8IY33	904 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CHST13	Q8NET6	341 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SGK3	Q96BR1	496 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SMIM14	Q96QK8	99 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SMO	Q99835	787 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	APOL5	Q9BWW9	433 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	OSER1	Q9NX31	292 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	DVL2	O14641	736 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	FFAR2	O15552	330 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	B4GALT3	O60512	393 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	RP2	O75695	350 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	HMBS	P08397	361 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	SPP1	P10451	314 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CBR1	P16152	277 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	CTPS1	P17812	591 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEDD4L-229	ENST00000590506	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms