RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588003.5

IZUMO4-208, Transcript of IZUMO family member 4, human

TSL 3

Gene IZUMO4, Length 510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IZUMO4-208	ENST00000588003	STAR	P49675	285 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	LHX2	P50458	406 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	GFRA1	P56159	465 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TGFBI	Q15582	683 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	RNF175	Q8N4F7	328 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	UCN3	Q969E3	161 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TP53INP1	Q96A56	240 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	VPS39	Q96JC1	886 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	MED18	Q9BUE0	208 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	SNX15	Q9NRS6	342 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	PSAT1	Q9Y617	370 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	C2orf72	A6NCS6	295 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	CAPN14	A8MX76	684 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	RNF223	E7ERA6	249 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	PLOD2	O00469	737 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	CLGN	O14967	610 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	HCRTR2	O43614	444 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TTC4	O95801	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	UGT2B10	P36537	528 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	CASP2	P42575	452 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	HSPA7	P48741	367 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	CLDN18	P56856	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	SLAMF1	Q13291	335 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	BIK	Q13323	160 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	GAB1	Q13480	694 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	E2F2	Q14209	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	SNX31	Q8N9S9	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TANK	Q92844	425 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	RIT1	Q92963	219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	NODAL	Q96S42	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	KRT12	Q99456	494 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	OR51B5	Q9H339	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	SERHL	Q9NQF3	203 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	HEY2	Q9UBP5	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	OR10H2	O60403	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	GPR75	O95800	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	PLAU	P00749	431 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	CHM	P24386	653 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	ABCD3	P28288	659 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	GALNS	P34059	522 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	ATP5J2	P56134	94 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TAS2R39	P59534	338 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	FUT7	Q11130	342 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	CHIT1	Q13231	466 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	GPR180	Q86V85	440 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	LAS2	Q8IYD9	372 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	RDH11	Q8TC12	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	HGD	Q93099	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IZUMO4-208	ENST00000588003	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms