RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 OR6C74A6NCV1 312 aa20.38■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 FRKP42685 505 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 OR4C11Q6IEV9 310 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ASRGL1Q7L266 308 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ELP5Q8TE02 316 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 MROQ9BYG7 248 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf196B1AJZ1 125 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PTTG1O95997 202 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 GPR4P46093 362 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PPP5CP53041 499 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 CDK10Q15131 360 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 UGT3A2Q3SY77 523 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ACTR6Q9GZN1 396 aa20.38■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 PCTPQ9UKL6 214 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 OXTRP30559 389 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PYCR1P32322 319 aa20.38■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM225Q6GV28 225 aa20.38■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.38■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.38■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ENY2Q9NPA8 101 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 G3V2L1 256 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM234Q8WY98 164 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ETFAP13804 333 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 UQCRC1P31930 480 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 COMTD1Q86VU5 262 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 LHPPQ9H008 270 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 OR7G2Q8NG99 324 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PTCHD1Q96NR3 888 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 NNATQ16517 81 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 HDHD5Q9BXW7 423 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC22A31A6NKX4 558 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 NETO1Q8TDF5 533 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC3AO75596 197 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 CARD17Q5XLA6 110 aa20.36■□□□□ 0.85
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