RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 UTS2BQ765I0 119 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LINGO2Q7L985 606 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IQCKQ8N0W5 287 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GPC2Q8N158 579 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KBTBD3Q8NAB2 608 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MLKLQ8NB16 471 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR10H4Q8NGA5 316 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR1J2Q8NGS2 313 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SPATA22Q8NHS9 363 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HM13Q8TCT9 377 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAR1Q8WVX9 515 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HTR3CQ8WXA8 447 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ST8SIA1Q92185 356 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PROX1Q92786 737 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GLG1Q92896 1179 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MAP4K1Q92918 833 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 P2RX5Q93086 422 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GLYATL1Q969I3 302 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC35B4Q969S0 331 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MCHR2Q969V1 340 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 VOPP1Q96AW1 172 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC127Q96BQ5 260 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF183Q96D59 192 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 REPS1Q96D71 796 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 B3GALT6Q96L58 329 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TSSK2Q96PF2 358 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR6C1Q96RD1 312 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RIT2Q99578 217 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 COPS8Q99627 209 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 APOL2Q9BQE5 337 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC2Q9BYS8 371 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PRRG4Q9BZD6 226 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TM6SF1Q9BZW5 370 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MIS12Q9H081 205 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GANQ9H2C0 597 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRA2Q9H9E1 313 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 Q9N2J8 555 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MIS18AQ9NYP9 233 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ADA2Q9NZK5 511 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 P2RX2Q9UBL9 471 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EPHA6Q9UF33 1036 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LCMT1Q9UIC8 334 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF639Q9UID6 485 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MAN1B1Q9UKM7 699 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TIMM22Q9Y584 194 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SMARCA2P51531 1590 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FANCIQ9NVI1 1328 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRN3E7EW58 273 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NPIPA7E9PJI5 369 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SGK494L7N484 410 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 VCYO14598 125 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 INSIG1O15503 277 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RS1O15537 224 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GRAP2O75791 330 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CNTN5O94779 1100 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 AP2A2O94973 939 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FADS2O95864 444 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms