RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM46Q7Z4K8 759 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 VWA5B2Q8N398 1253 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10G3Q8NGC4 313 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf52Q8NHV5 167 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC22A8Q8TCC7 542 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 AGR3Q8TD06 166 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PKNOX2Q96KN3 472 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SMC6Q96SB8 1091 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 FAIM2Q9BWQ8 316 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10A5Q9H207 317 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SH2D2AQ9NP31 389 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNA1CQ13936 2221 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA6L10A6NI86 522 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 AZIN1O14977 448 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC19A2O60779 497 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ZG16O60844 167 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 NME6O75414 186 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CBX7O95931 251 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 UROSP10746 265 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PCSK2P16519 638 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 GPX3P22352 226 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 DEKP35659 375 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGAP37287 484 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ETV4P43268 484 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 NAA20P61599 178 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF763Q0D2J5 394 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 C3AR1Q16581 482 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CMPK2Q5EBM0 449 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 OPN5Q6U736 354 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR22Q8IZ63 422 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLM1Q8NBJ4 401 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 C7orf57Q8NEG2 295 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52N2Q8NGI0 321 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5M3Q8NGP4 307 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 OR9A2Q8NGT5 310 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ZIM3Q96PE6 472 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ITPAQ9BY32 194 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TTTY12Q9BZ98 90 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 LIPGQ9Y5X9 500 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6C76A6NM76 312 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ASNA1O43681 348 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO45P0C2W1 286 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TACR1P25103 407 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CA7P43166 264 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF628Q5EBL2 1059 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf163Q5TEZ5 329 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 POGLUT1Q8NBL1 392 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM13CQ8NE31 585 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ADIPOR1Q96A54 375 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGED4Q96JG8 741 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PFDN4Q9NQP4 134 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SIRT5Q9NXA8 310 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 GIMAP2Q9UG22 337 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF639Q9UID6 485 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BQF6 201 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 NPHS1O60500 1241 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXW4P57775 412 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP85LQ5SZL2 805 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 BICRALQ6AI39 1079 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 DESI1Q6ICB0 168 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM47EQ6ZV65 393 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC116Q8IYX3 515 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52R1Q8NGF1 315 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 KAT2AQ92830 837 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CTHRC1Q96CG8 243 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC120Q96HB5 630 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PROK2Q9HC23 129 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 MYNNQ9NPC7 610 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SACM1LQ9NTJ5 587 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF835Q9Y2P0 537 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 GLSO94925 669 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 BPGMP07738 259 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CELA3AP09093 270 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00032P0C843 101 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 GP1BBP13224 206 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 DDCP20711 480 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPH2P23942 346 aa17.22■□□□□ 0.35
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