RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RFX4	Q33E94	735 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MANEA	Q5SRI9	462 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	BORA	Q6PGQ7	559 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	IYD	Q6PHW0	289 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM64	Q6YI46	380 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZSR6	202 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	AVL9	Q8NBF6	648 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2L5	Q8NG80	312 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SFXN5	Q8TD22	340 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX19	Q92543	992 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM162A	Q96A26	154 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM10	Q96HG1	83 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C7orf34	Q96L11	122 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNC2	Q96PR1	638 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	F2RL3	Q96RI0	385 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NELL2	Q99435	816 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NRTN	Q99748	197 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PSD2	Q9BQI7	771 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ADI1	Q9BV57	179 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	EMC7	Q9NPA0	242 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NTM	Q9P121	344 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	WNT16	Q9UBV4	365 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ASB4	Q9Y574	426 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PR77	199 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM149A	A5PLN7	773 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR23A	A6NEV1	266 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BNH8	94 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	BTN3A3	O00478	584 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	EI24	O14681	340 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	HAT1	O14929	419 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC16A6	O15403	523 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TPST1	O60507	370 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	H6PD	O95479	791 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TNF	P01375	233 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C1QC	P02747	245 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TFAP2A	P05549	437 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LINGO3	P0C6S8	592 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PI3	P19957	117 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CAPG	P40121	348 aa		5.23	□□□□□ -1.57

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