RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487288.1

TAF6-215, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 6, human

TSL 5

Gene TAF6, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF6-215	ENST00000487288	TP53INP1	Q96A56	240 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	REPS1	Q96D71	796 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288		A0A096LPK6	155 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288		A6NNC1	897 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	DVL2	O14641	736 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	KLHL2	O95198	593 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	S1PR1	P21453	382 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	TIMP3	P35625	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	CASP3	P42574	277 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	ASCL1	P50553	236 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	PHEX	P78562	749 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	CAV1	Q03135	178 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	CEBPE	Q15744	281 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	VASN	Q6EMK4	673 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	CDC20B	Q86Y33	519 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	OR10A5	Q9H207	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	WDR41	Q9HAD4	459 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	TP53I11	O14683	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	SEMA3D	O95025	777 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	CLDN9	O95484	217 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	KLK1	P06870	262 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	BMP7	P18075	431 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	PIK3R1	P27986	724 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	SOX18	P35713	384 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	XK	P51811	444 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	EIPR1	Q53HC9	387 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	LACC1	Q8IV20	430 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	MMP21	Q8N119	569 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	SERPINI1	Q99574	410 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
TAF6-215	ENST00000487288	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288		A0A1B0GTL3	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ESYT3	A0FGR9	886 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CAPN14	A8MX76	684 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	GNB5	O14775	395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SNX4	O95219	450 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CPM	P14384	443 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	KLK2	P20151	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	GPX3	P22352	226 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TACR1	P25103	407 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ABCD3	P28288	659 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MASP1	P48740	699 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MGAT2	Q10469	447 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TRAF3	Q13114	568 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FAM222B	Q8WU58	562 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PHF21B	Q96EK2	531 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	RAB17	Q9H0T7	212 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ACAN	P16112	2415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	C2orf72	A6NCS6	295 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms