RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SCGB2A2Q13296 93 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 CALCRLQ16602 461 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 PHKG1Q16816 387 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 MTX3Q5HYI7 312 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 STXBP5Q5T5C0 1151 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 FUT10Q6P4F1 479 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 RGS9BPQ6ZS82 235 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM26Q6ZUK4 368 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 RTN4RL2Q86UN3 420 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 CTAGE4Q8IX94 777 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 RDM1Q8NG50 284 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 IGSF21Q96ID5 467 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 TAAR6Q96RI8 345 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 PALMDQ9NP74 551 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 OLFML3Q9NRN5 406 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 MALT1Q9UDY8 824 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 TNNQ9UQP3 1299 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 IKBKGQ9Y6K9 419 aa5.07□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0G2JPF8 293 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR91A4D1P6 747 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 ANGPT2O15123 496 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 RRP8O43159 456 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAM12O43184 909 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 LANCL1O43813 399 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SCO2O43819 266 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 GMNNO75496 209 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 ECI2O75521 394 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 PMS2P2O95744 297 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF18P17022 549 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 PKLRP30613 574 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 MBTD1Q05BQ5 628 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 KLC1Q07866 573 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 XKR3Q5GH77 459 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 CLLU1OSQ5K130 101 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 MARCH8Q5T0T0 291 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 CDK20Q8IZL9 346 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF148Q8N7C7 305 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 ITFG1Q8TB96 612 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 ELP5Q8TE02 316 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SELENOMQ8WWX9 145 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGAP45Q92619 1136 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 LGALS12Q96DT0 336 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 COQ7Q99807 217 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SDCBP2Q9H190 292 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 CENPMQ9NSP4 180 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SPHK1Q9NYA1 384 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 IL20RAQ9UHF4 553 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 U3KQV3 271 aa5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 JMJD1CQ15652 2540 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 ZMYM6O95789 1325 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1B0GWJ7 208 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 DENND3A2RUS2 1198 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM89A2RUT3 159 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 E5RGE8 158 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 MCF2LO15068 1137 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 PRKAB2O43741 272 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 GAS8O95995 478 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 GLUD1P00367 558 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 TPM2P07951 284 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 PDHBP11177 359 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT13P13646 458 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 SOX6P35712 828 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 NSFP46459 744 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFSF10P50591 281 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 MLLT10P55197 1068 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 ZXDBP98169 803 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 CDH18Q13634 790 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT31Q15323 416 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP55Q53EZ4 464 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF542PQ5EBM4 170 aa5.05□□□□□ -1.6
STRADBP1-201ENST00000478954 TEX35Q5T0J7 233 aa5.05□□□□□ -1.6
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