RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PSD4Q8NDX1 1056 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SELENOMQ8WWX9 145 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ASB15Q8WXK1 588 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FRG2BQ96QU4 278 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 HBEGFQ99075 208 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NTMT1Q9BV86 223 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 UCK2Q9BZX2 261 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 MANSC1Q9H8J5 431 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 OXSMQ9NWU1 459 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC13O75165 2243 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GTL3 188 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TMEM200CA6NKL6 621 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NPIPA2E9PIF3 369 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NPIPA3F8WFD2 350 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 LDB3O75112 727 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SERPINE1P05121 402 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TNNI3P19429 210 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PPP2R1BP30154 601 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 HMOX2P30519 316 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 RFC3P40938 356 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PRKAA2P54646 552 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NAGLUP54802 743 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 HSD17B7P56937 341 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 DNAJB13P59910 316 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GPR85P60893 370 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PPIAP62937 165 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 STX3Q13277 289 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GXYLT1Q4G148 440 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CFAP157Q5JU67 520 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NUDT13Q86X67 352 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZNF595Q8IYB9 648 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 C7orf57Q8NEG2 295 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 WDR20Q8TBZ3 569 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NRGNQ92686 78 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SARAFQ96BY9 339 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SERPINI1Q99574 410 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 LYRM4Q9HD34 91 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TRPS1Q9UHF7 1281 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SNX6Q9UNH7 406 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SLC12A4Q9UP95 1085 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ACANP16112 2415 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TGFBR3LH3BV60 316 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CYR61O00622 381 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CRCPO75575 148 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CTAG2O75638 210 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PDE9AO76083 593 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PDYNP01213 254 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GABRA1P14867 456 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 IMPDH1P20839 514 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 LSP1P33241 339 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 KIR2DL3P43628 341 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 DGKQP52824 942 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CBX1P83916 185 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 BST1Q10588 318 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CUL3Q13618 768 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GGTA1PQ4G0N0 100 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 WLSQ5T9L3 541 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ATG16L1Q676U5 607 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZNF585AQ6P3V2 769 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ARSKQ6UWY0 536 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FAM47EQ6ZV65 393 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GPR180Q86V85 440 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SCUBE1Q8IWY4 988 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 OR4N5Q8IXE1 308 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FAM109AQ8N4B1 249 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 APCDD1LQ8NCL9 501 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 OR52N2Q8NGI0 321 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 L3HYPDHQ96EM0 354 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SGCZQ96LD1 299 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FAM173AQ9BQD7 235 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TTYH2Q9BSA4 534 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 DEFB127Q9H1M4 99 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CCDC134Q9H6E4 229 aa10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms