RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 SLC7A13Q8TCU3 470 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CXorf40AQ8TE69 158 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RGMAQ96B86 450 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SLC35G5Q96KT7 338 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SOSTQ9BQB4 213 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZBP1Q9H171 429 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 KLF15Q9UIH9 416 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SH2B3Q9UQQ2 575 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 POLHQ9Y253 713 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 EFCAB14O75071 495 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SH3BGRLO75368 114 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PAPLNO95428 1278 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ADH1AP07327 375 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 C8AP07357 584 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SYN1P17600 705 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MAGP20916 626 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MYL9P24844 172 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CCR8P51685 355 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 BDH1Q02338 343 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CHRNEQ04844 493 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GINS1Q14691 196 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CARTPTQ16568 116 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 BAK1Q16611 211 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PRSS53Q2L4Q9 553 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 DEF8Q6ZN54 512 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 DUSP18Q8NEJ0 188 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TMIEQ8NEW7 156 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ACOT12Q8WYK0 555 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 NUS1Q96E22 293 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RNF170Q96K19 258 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PINK1Q9BXM7 581 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RHCGQ9UBD6 479 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0G2JPF8 293 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 B4DXG7 233 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ANHXE9PGG2 379 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SLC28A2O43868 658 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TMCC2O75069 709 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SOD1P00441 154 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 FGBP02675 491 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CTSLP07711 333 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CSF3P09919 207 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 IFNA8P32881 189 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TAB1Q15750 504 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM60Q495X7 471 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 LIPKQ5VXJ0 399 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PLCZ1Q86YW0 608 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MORN4Q8NDC4 146 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ENKURQ8TC29 256 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 FAIM2Q9BWQ8 316 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RNF208Q9H0X6 261 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ABCB9Q9NP78 766 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ASB6Q9NWX5 421 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CALML5Q9NZT1 146 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 DENND4AQ7Z401 1863 aa15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SGK494L7N484 410 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PRKYO43930 277 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SLC19A2O60779 497 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GUCY1B2O75343 617 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CLEC3AO75596 197 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ALX3O95076 343 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GBAP04062 536 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MSL3P1P0C860 447 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PRKAR1AP10644 381 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RCVRNP35243 200 aa15.92■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms