RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CCR7P32248 378 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR4P46093 362 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 CST9Q5W186 159 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 LCTLQ6UWM7 567 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 PLXDC1Q8IUK5 500 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 SCGB3A2Q96PL1 93 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 CLRN1P58418 232 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 GAS6Q14393 721 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf94Q6P1W5 598 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 THAP4Q8WY91 577 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 FGF13Q92913 245 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF69Q9UC07 566 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC1A7O00341 560 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP6CO00743 305 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 PGCP20142 388 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 CTSCP53634 463 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 CD83Q01151 205 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 CGB2Q6NT52 195 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC5A8Q8N695 610 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 NTMT1Q9BV86 223 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 NUAK1O60285 661 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF45Q02386 682 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM73Q86UV7 250 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 NXPE2Q96DL1 559 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 LGALS12Q96DT0 336 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJA3Q96EY1 480 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTRT3Q9BYD9 372 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 GXYLT2A0PJZ3 443 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 PYCR1P32322 319 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 DNASE1L3Q13609 305 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 GJB3O75712 270 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 TNFRSF1BP20333 461 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ADRA1AP35348 466 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNJ5P48544 419 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 DSC1Q08554 894 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 GBX1Q14549 363 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 SAMD12Q8N8I0 201 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A31A6NKX4 558 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 DRD1P21728 446 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 GABARAPL2P60520 117 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 MYF6P23409 242 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 HLA-FP30511 346 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM34P42696 430 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 TCTE1Q5JU00 501 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ACOT12Q8WYK0 555 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 KDM4BO94953 1096 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 FCER2P06734 321 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 VAPAQ9P0L0 249 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 LAMTOR5O43504 91 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 CCNOP22674 350 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 VAMP1P23763 118 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAM1Q15629 374 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 RTL10Q7L3V2 364 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF283Q8N7M2 679 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 FRMD6Q96NE9 622 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 MROQ9BYG7 248 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 EXTL2Q9UBQ6 330 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 LHX3Q9UBR4 397 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 HTR3EA5X5Y0 456 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 SOBPA7XYQ1 873 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 PDHA2P29803 388 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 HSD17B12Q53GQ0 312 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF615Q8N8J6 731 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC37A3Q8NCC5 494 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM210AQ96ND0 272 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ACPTQ9BZG2 426 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 NANSQ9NR45 359 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-201ENST00000418331 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms