RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 OR7G2Q8NG99 324 aa23■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 RNF145Q96MT1 663 aa23■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 P2RX2Q9UBL9 471 aa23■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 RPS6KA6Q9UK32 745 aa23■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 TCRBV5S2A0A599 114 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 DUXAA6NLW8 204 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 COQ9O75208 318 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 NUDT7P0C024 238 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 CDK6Q00534 326 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 OCA2Q04671 838 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 MAP4K2Q12851 820 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 SCARB2Q14108 478 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC157Q569K6 752 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 VWA5B2Q8N398 1253 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 HORMAD2Q8N7B1 307 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 RIT1Q92963 219 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 CTHRC1Q96CG8 243 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 LRFN5Q96NI6 719 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 DEPDC7Q96QD5 511 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ZPBPQ9BS86 351 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 UGT2B28Q9BY64 529 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 MAT2BQ9NZL9 334 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 STOML1Q9UBI4 398 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 AP4S1Q9Y587 144 aa22.99■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 C5orf58C9J3I9 102 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 PROB1E7EW31 1015 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 DYRK3O43781 588 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 SOX30O94993 753 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 TIAF1O95411 115 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 AGXTP21549 392 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 RORAP35398 523 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 LIMK1P53667 647 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC34A1Q06495 639 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ERV3-1Q14264 604 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 LGI4Q8N135 537 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 PTCHD1Q96NR3 888 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 OR51I1Q9H343 314 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 CXorf21Q9HAI6 301 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 APMAPQ9HDC9 416 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ARMC1Q9NVT9 282 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC39A1Q9NY26 324 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 LOXL2Q9Y4K0 774 aa22.98■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 IFNA14P01570 189 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ANPEPP15144 967 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 KDELR2P33947 212 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 RPS26P62854 115 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 BTG2P78543 158 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ISXQ2M1V0 245 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 FHL5Q5TD97 284 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 SHISA5Q8N114 240 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 FKBP10Q96AY3 582 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 H3BNX3 289 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 HMGN4O00479 90 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 GDF9O60383 454 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 CYC1P08574 325 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 MAOAP21397 527 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 PTGER1P34995 402 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 CASP9P55211 416 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 REEP3Q6NUK4 255 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC80Q76M96 950 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ADGRG5Q8IZF4 528 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 NETO1Q8TDF5 533 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 CANT1Q8WVQ1 401 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 MAL2Q969L2 176 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 GIMAP5Q96F15 307 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 YY1AP1Q9H869 796 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.97■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 FRYLO94915 3013 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 AGRPO00253 132 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 BAG2O95816 211 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 MT-CO3P00414 261 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 SERPINA1P01009 418 aa22.96■■□□□ 1.27
ECHDC3-201ENST00000379215 ALBP02768 609 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms