RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF157Q96PX1 679 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C19orf43Q9BQ61 176 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR61Q9BZJ8 451 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IFI27L2Q9H2X8 130 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LIME1Q9H400 295 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTGES2Q9H7Z7 377 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LY9Q9HBG7 655 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TIGARQ9NQ88 270 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NRBP1Q9UHY1 535 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CORO2BQ9UQ03 480 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDH10Q9Y6N8 788 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTPRTO14522 1441 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 K7EP34 96 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBP2O00757 339 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DEFB4AO15263 64 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VAMP5O95183 116 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNTTP04053 509 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGKV1-13P0DP09 117 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAPPC10P48553 1259 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC1A6P48664 564 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TKTL1P51854 596 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTTPP55157 894 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC10A1Q14973 349 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LGALS9BQ3B8N2 356 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM106AQ4KMX7 169 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C14orf28Q4W4Y0 310 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PARP10Q53GL7 1025 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF805Q5CZA5 627 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LGALS9CQ6DKI2 356 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC27A4Q6P1M0 643 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF165Q6ZSG1 346 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TADA2BQ86TJ2 420 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF101Q8IZC7 436 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARL14Q8N4G2 192 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSPYL6Q8N831 410 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKRD49Q8WVL7 239 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RCHY1Q96PM5 261 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CSPG4P5Q96PW8 444 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM14Q96QK8 99 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CNPY3Q9BT09 278 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BRD8Q9H0E9 1235 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DCTPP1Q9H773 170 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNK13Q9HB14 408 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRPV4Q9HBA0 871 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABCC13Q9NSE7 274 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYO1AQ9UBC5 1043 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DAPK2Q9UIK4 370 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 L1RE1Q9UN81 338 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXO7Q9Y3I1 522 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 R4GN57 208 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCN2AQ99250 2005 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MBD5Q9P267 1494 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUMA1Q14980 2115 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A0D9SG42 100 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF850A8MQ14 1090 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 O00370 1275 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDC45O75419 566 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLHL2O95198 593 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HOXB5P09067 269 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CSF1P09603 554 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SBK2P0C263 348 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDGFRAP16234 1089 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERPINA4P29622 427 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BMI1P35226 326 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SFTPDP35247 375 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLCXD2Q0VAA5 305 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRPC3Q13507 836 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPS6KA2Q15349 733 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHLDA2Q53GA4 152 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCP11X2Q5H9J9 407 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NT5DC3Q86UY8 548 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF100Q8IYN0 542 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATL2Q8NHH9 583 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPACA4Q8TDM5 124 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR119Q8TDV5 335 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GIMAP1Q8WWP7 306 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM158Q8WZ71 300 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAF4BQ92750 862 aa-1.96□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms