RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 MLC1Q15049 377 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 USP3Q9Y6I4 520 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 FAM189A1O60320 539 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 IRF4Q15306 451 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ISCA2Q86U28 154 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 AGBL5Q8NDL9 886 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RNF38Q9H0F5 515 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PCTPQ9UKL6 214 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 VAMP1P23763 118 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SOX2P48431 317 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 LAPTM4AQ15012 233 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 FAM26DQ5JW98 314 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 GPR150Q8NGU9 434 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TANKQ92844 425 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 KCNN1Q92952 543 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NFS1Q9Y697 457 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PRSS38A1L453 326 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ANHXE9PGG2 379 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 GFRA2O00451 464 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SOCS2O14508 198 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ADAM12O43184 909 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NDUFV2P19404 249 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CTBSQ01459 385 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF613Q6PF04 617 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR7G3Q8NG95 312 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MNTQ99583 582 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TOR3AQ9H497 397 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PISDQ9UG56 409 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 F3P13726 295 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 POU4F2Q12837 409 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CDKN3Q16667 212 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PITX2Q99697 317 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 C17orf105B2RV13 164 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TUBA1BP68363 451 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TUBA4AP68366 448 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RBPJQ06330 500 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CDK10Q15131 360 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TUBA1AQ71U36 451 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR2T4Q8NH00 348 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PSKH1P11801 424 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 THBS2P35442 1172 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR2L2Q8NH16 312 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 A6NL46 340 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CDRT1O95170 752 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ATF6P18850 670 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CEBPGP53567 150 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 EFR3AQ14156 821 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 KDELC1Q6UW63 502 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC22A4Q9H015 551 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 KCNK12Q9HB15 430 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.3 ms