RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ5P48544 419 aa16.8■□□□□ 0.28
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ACTB-201ENST00000331789 C21orf59P57076 290 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 SHC2P98077 582 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 ZNF691Q5VV52 312 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 OGFOD3Q6PK18 319 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 TSSK4Q6SA08 328 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 FAM111BQ6SJ93 734 aa16.8■□□□□ 0.28
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ACTB-201ENST00000331789 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
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ACTB-201ENST00000331789 SEC14L3Q9UDX4 400 aa16.8■□□□□ 0.28
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ACTB-201ENST00000331789 SLC35A4Q96G79 324 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 ZNF354BQ96LW1 612 aa16.78■□□□□ 0.28
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ACTB-201ENST00000331789 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.78■□□□□ 0.28
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ACTB-201ENST00000331789 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 SPACA6W5XKT8 324 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 GADD45GO95257 159 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 AGXTP21549 392 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 LIMS1P48059 325 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 BNIP3Q12983 259 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 PRTGQ2VWP7 1150 aa16.78■□□□□ 0.28
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