RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 COL26A1Q96A83 441 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ELP4Q96EB1 424 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf90Q96M02 699 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN10Q9HC96 672 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA5BQ9P283 1151 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSL6Q9UKU0 697 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB26Q9ULW5 256 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FITM1A5D6W6 292 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM149AA5PLN7 773 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF860A6NHJ4 632 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SGK494L7N484 410 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CYR61O00622 381 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HCRTR1O43613 425 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SIGLEC6O43699 453 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINB7O75635 380 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE9AO76083 593 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SLITRK5O94991 958 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX30O94993 753 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 C1QCP02747 245 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NID1P14543 1247 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 UQCRBP14927 111 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CKMT2P17540 419 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 AVPR2P30518 371 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SEPHS1P49903 392 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCN2P51788 898 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OLR1P78380 273 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 BIKQ13323 160 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MED21Q13503 144 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SFT2D3Q587I9 215 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE1DQ5T752 114 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR9A4Q8NGU2 314 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SUN3Q8TAQ9 357 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RASSF5Q8WWW0 418 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TPD52L3Q96J77 140 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LOXL4Q96JB6 756 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS50Q96JG6 964 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGED4Q96JG8 741 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF607Q96SK3 696 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CIB1Q99828 191 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DOHHQ9BU89 302 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SAC3D1A6NKF1 404 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 H0YIG0 161 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PLOD2O00469 737 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGN4O00479 90 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGA12O60330 932 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CTNSO60931 367 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJB6O75190 326 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RDH16O75452 317 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 E2F6O75461 281 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2B3O76000 313 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CPNE6O95741 557 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 AGR2O95994 175 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FABP3P05413 133 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TFPTP0C1Z6 253 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MSL3P1P0C860 447 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SP9P0CG40 484 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR12D1P0DN82 309 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NR2F1P10589 423 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF23P17027 643 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGA2P17301 1181 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP1P29972 269 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRA4P48169 554 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 KHKP50053 298 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK10P53779 464 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ARSFP54793 590 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP4P55087 323 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FOLH1Q04609 750 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms