RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308394.8

CASP3-201, Transcript of caspase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP3, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3-201ENST00000308394 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CPED1A4D0V7 1026 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 RAB19A4D1S5 217 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ATP6V1G2O95670 118 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CER1O95813 267 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 C9P02748 559 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 SYPP08247 313 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 FAM58BPP0C7Q3 252 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CERS1P27544 350 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CDKN2CP42773 168 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 WNT3P56703 355 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 RELAQ04206 551 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 GTDC1Q4AE62 458 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ZNF385BQ569K4 471 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 EID2Q8N6I1 236 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 OR4C6Q8NH72 309 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 PRR7Q8TB68 274 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 STMN2Q93045 179 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 GAL3ST3Q96A11 431 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 TMEM125Q96AQ2 219 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 COQ8BQ96D53 544 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 GBP5Q96PP8 586 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 PCDHAC1Q9H158 963 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 SLC6A13Q9NSD5 602 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ABCD2Q9UBJ2 740 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 PI4KAP42356 2102 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 B4GAT1O43505 415 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 FRS3O43559 492 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 HCRTR1O43613 425 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 SIGLEC6O43699 453 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 DUX1O43812 170 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ADAM11O75078 769 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ANPEPP15144 967 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 DDCP20711 480 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 GPR3P46089 330 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 IST1P53990 364 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ACTR3P61158 418 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 KCNJ10P78508 379 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 MS4A2Q01362 244 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 LGALS3BPQ08380 585 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 FLOT2Q14254 428 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 DEFB134Q4QY38 66 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 RNF220Q5VTB9 566 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CAMKMTQ7Z624 323 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ARPINQ7Z6K5 226 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CSNK1A1LQ8N752 337 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ZNF680Q8NEM1 530 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CCDC74AQ96AQ1 378 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 TCTN2Q96GX1 697 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ANKRD27Q96NW4 1050 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 TM9SF2Q99805 663 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ECSITQ9BQ95 431 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 SPACA1Q9HBV2 294 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 C5AR2Q9P296 337 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CD300AQ9UGN4 299 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 R4GN57 208 aa10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 A0A096LPI6 279 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 TLCD2A6NGC4 264 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 SCN2BO60939 215 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 HMGN1P05114 100 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 TSFMP43897 325 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 SELPLGQ14242 412 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 NR0B2Q15466 257 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ABHD13Q7L211 337 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 PLXDC1Q8IUK5 500 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 GALNT12Q8IXK2 581 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 MTERF3Q96E29 417 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 NLNQ9BYT8 704 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 ALG2Q9H553 416 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 RUBCNLQ9H714 662 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 PCDHGB4Q9UN71 923 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 POLHQ9Y253 713 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CACNA1EQ15878 2313 aa10.12□□□□□ -0.79
CASP3-201ENST00000308394 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms