RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 KRT73Q86Y46 540 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 VWA5B2Q8N398 1253 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ALG5Q9Y673 324 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SPEGQ15772 3267 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 KLK1P06870 262 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ADRB3P13945 408 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 QPRTQ15274 297 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 MPEG1Q2M385 716 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 LAS2Q8IYD9 372 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 BADQ92934 168 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 NRTNQ99748 197 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 COQ7Q99807 217 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SLA2Q9H6Q3 261 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 C5AR2Q9P296 337 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TNFRSF21O75509 655 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 KLHL18O94889 574 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 PAPLNO95428 1278 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 RECKO95980 971 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 CD79BP40259 229 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ETV5P41161 510 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 XCR1P46094 333 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ETV1P50549 477 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 PNLIPRP1P54315 467 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TAS2R50P59544 299 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF91Q05481 1191 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 NXPE4Q6UWF7 544 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SETD6Q8TBK2 473 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 C16orf78Q8WTQ4 265 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 WDR34Q96EX3 536 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM80Q96HE8 168 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 GALNT9Q9HCQ5 603 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 STUB1Q9UNE7 303 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 CHD9Q3L8U1 2897 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRK1Q38SD2 2015 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 MYL12BO14950 172 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 FURINP09958 794 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TEAD4Q15561 434 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 PLET1Q6UQ28 207 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TIGD4Q8IY51 512 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 PPCDCQ96CD2 204 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 NELL2Q99435 816 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 MCUBQ9NWR8 336 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ASF1AQ9Y294 204 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 GPR52Q9Y2T5 361 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SZT2Q5T011 3432 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC35F4A4IF30 521 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM25AB3EWG3 89 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM25CB3EWG5 89 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM25GB3EWG6 89 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 PTGER1P34995 402 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 OR3A3P47888 321 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 CEACAM20Q6UY09 585 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 OR52P1PQ8NH57 321 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 HPGDSO60760 199 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ACADLP28330 430 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 EVI2BP34910 448 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC32Q14392 662 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 PLA2G15Q8NCC3 412 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TMIEQ8NEW7 156 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms