RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GATSQ8NAP1 163 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR2T29Q8NH02 315 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 UCN3Q969E3 161 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PTERQ96BW5 349 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NXPE2Q96DL1 559 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TEX101Q9BY14 249 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 UCK2Q9BZX2 261 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NT5DC2Q9H857 520 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 RASSF1Q9NS23 344 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NME7Q9Y5B8 376 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PTPRFP10586 1907 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LILRA5A6NI73 299 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 VILLO15195 856 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 BCL10O95999 233 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 C9P02748 559 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OPN1SWP03999 348 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 RETP07949 1114 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 HK1P19367 917 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 RCVRNP35243 200 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SLC6A9P48067 706 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PON3Q15166 354 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NNATQ16517 81 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LOXL4Q96JB6 756 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 C4orf47A7E2U8 309 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 IGHA2P01877 340 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 BMP1P13497 986 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GDF1P27539 372 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GSK3BP49841 420 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TEX19Q8NA77 164 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 THRSPQ92748 146 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TAAR9Q96RI9 348 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 A0A1B0GW55 424 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 POM121BA6NF01 834 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PCDH17O14917 1159 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FESP07332 822 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 UBL4AP11441 157 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 C4BPBP20851 252 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PTGR1Q14914 329 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FAM189A2Q15884 450 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MISPQ8IVT2 679 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 STMN3Q9NZ72 180 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DUX4Q9UBX2 424 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TMEM202A6NGA9 273 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SEC14L5O43304 696 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CPMP14384 443 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LHCGRP22888 699 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MAGEA8P43361 318 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR1D4P47884 311 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PGFP49763 221 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CHN2P52757 468 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DIO3P55073 304 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TNFRSF17Q02223 184 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MYBPC3Q14896 1274 aa7.56□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MED22Q15528 200 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms