RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 RAP1GDS1P52306 607 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP10-9P60411 292 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MXRA7P84157 204 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MTFR2Q6P444 385 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP20A1Q6UW02 462 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF835Q9Y2P0 537 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTM2P28161 218 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PGM1P36871 562 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PHEXP78562 749 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 RCAN2Q14206 197 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 GARNL3Q5VVW2 1013 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ICE2Q659A1 982 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 XKRXQ6PP77 449 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ROPN1LQ96C74 230 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SARGQ9BW04 601 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 TAC3Q9UHF0 121 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 TINAGQ9UJW2 476 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PP18 115 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 NPPAP01160 153 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 G6PDP11413 515 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 AGAP20933 346 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 KIR3DL1P43629 444 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CUL3Q13618 768 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD17BQ5VST6 288 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT18Q6P9A2 607 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 HUS1BQ8NHY5 278 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO27Q8NI29 283 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 HBEGFQ99075 208 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 NPAS2Q99743 824 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 VN1R1Q9GZP7 353 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM184CQ9NVA4 438 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 STMN3Q9NZ72 180 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MKL2Q9ULH7 1088 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PRMT3O60678 531 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH1P12830 882 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN8P56748 225 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 RIPK1Q13546 671 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PGM2L1Q6PCE3 622 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 GK5Q6ZS86 529 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 LANCL3Q6ZV70 420 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ACBD4Q8NC06 268 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MDS2Q8NDY4 140 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLQ8NG68 377 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CHTF18Q8WVB6 975 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINI1Q99574 410 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SH2B3Q9UQQ2 575 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 FBP2O00757 339 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 AIM2O14862 343 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 BCKDHAP12694 445 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CD1EP15812 388 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 C21orf58P58505 322 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A3Q00325 362 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 REEP5Q00765 189 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 RELAQ04206 551 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SPIN4Q56A73 249 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF766Q5HY98 468 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 FCRLBQ6BAA4 426 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 RCN3Q96D15 328 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf50Q9BV19 199 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 HES7Q9BYE0 225 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEB17A8MXT2 336 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ICAM2P13598 275 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 UFM1P61960 85 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM53BQ14153 422 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MMEL1Q495T6 779 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PLAG1Q6DJT9 500 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 NOXRED1Q6NXP6 359 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS41Q7RTY9 318 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
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