RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 DKK4Q9UBT3 224 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 COPS7AQ9UBW8 275 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CTSFQ9UBX1 484 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PRODH2Q9UF12 536 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CROTQ9UKG9 612 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 TCFL5Q9UL49 500 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 DUXAA6NLW8 204 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 FBP2O00757 339 aa8.72□□□□□ -1.01
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CS-220ENST00000550700 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CBX6O95503 412 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 C6orf47O95873 294 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 NT5EP21589 574 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 DLSTP36957 453 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 OR4D2P58180 307 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 DCAF7P61962 342 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 HBA1P69905 142 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PHC1P78364 1004 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 BTG2P78543 158 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 GNA13Q14344 377 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 EXT1Q16394 746 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.72□□□□□ -1.01
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CS-220ENST00000550700 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CT55Q8WUE5 264 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 FGF11Q92914 225 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PMEPA1Q969W9 287 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ELP4Q96EB1 424 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CGREF1Q99674 301 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 DPH1Q9BZG8 443 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SERHLQ9NQF3 203 aa8.72□□□□□ -1.01
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CS-220ENST00000550700 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.72□□□□□ -1.01
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CS-220ENST00000550700 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 TMEM247A6NEH6 219 aa8.71□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 C17orf105B2RV13 164 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 CLIC1O00299 241 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 PEX12O00623 359 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 CDK2AP1O14519 115 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 PRAMEF2O60811 474 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 NUDT7P0C024 238 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 T-ENOLP0DO92 83 aa8.71□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 PRIM2P49643 509 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 FUT7Q11130 342 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 HSPB3Q12988 150 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 ERV3-1Q14264 604 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 ZNF385BQ569K4 471 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.71□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.71□□□□□ -1.02
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