RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 OR2T1O43869 369 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CPZQ66K79 652 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ASB15Q8WXK1 588 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PMM1Q92871 262 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 HDAC8Q9BY41 377 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TP73O15350 636 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 YES1P07947 543 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FOSL2P15408 326 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GINS1Q14691 196 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FNDC8Q8TC99 324 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TPST2O60704 377 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TPK1Q9H3S4 243 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TOR3AQ9H497 397 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PPL8 197 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FAM72CH0Y354 149 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 OR12D1P0DN82 309 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 DDCP20711 480 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GJA8P48165 433 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FAM72BQ86X60 149 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FAM46BQ96A09 425 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC32Q9BV29 185 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GPR160Q9UJ42 338 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 HCN2Q9UL51 889 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf51A6NDU8 294 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 OR2AT4A6NND4 320 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 HCRTR2O43614 444 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GNAO1P09471 354 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PRLHRP49683 370 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MAB21L1Q13394 359 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PON2Q15165 354 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 C4orf46Q504U0 113 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SERPINA11Q86U17 422 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FAM110BQ8TC76 370 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 EMC3Q9P0I2 261 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 IL17CQ9P0M4 197 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 NUP98P52948 1817 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 KEAP1Q14145 624 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 HUS1BQ8NHY5 278 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SPTSSAQ969W0 71 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TGM7Q96PF1 710 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 HBEGFQ99075 208 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PKP2Q99959 881 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 KCNK13Q9HB14 408 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 STUB1Q9UNE7 303 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 AXIN1O15169 862 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GMFGO60234 142 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CD6P30203 668 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PRKCDQ05655 676 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 RBPJQ06330 500 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 NFATC4Q14934 902 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 UEVLDQ8IX04 471 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms