RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ART1P52961 327 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ACAP2Q15057 778 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 BICRALQ6AI39 1079 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 OR52E8Q6IFG1 317 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 NUDT13Q86X67 352 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 L3MBTL4Q8NA19 623 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 NEIL3Q8TAT5 605 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF597Q96LX8 424 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR78Q96P69 363 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 CDK15Q96Q40 435 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 IPPKQ9H8X2 491 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ESYT3A0FGR9 886 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 PGRMC2O15173 223 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 KLHL2O95198 593 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 CT62P0C5K7 136 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC35E2P0CK97 266 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 CD1EP15812 388 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 GDF1P27539 372 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 WNT3P56703 355 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXW4P57775 412 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 RPS6KA2Q15349 733 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 TECRLQ5HYJ1 363 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ARSKQ6UWY0 536 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 LIX1Q8N485 282 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 NAXEQ8NCW5 288 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 OR52B6Q8NGF0 335 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 DIO2Q92813 273 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR41Q9HAD4 459 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.53■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC189A1A4V9 331 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 OR7A17O14581 309 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 GALNSP34059 522 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 SERPINB8P50452 374 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 KLC3Q6P597 504 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 TAGAPQ8N103 731 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 RILPQ96NA2 401 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa15.52■□□□□ 0.08
SKIV2L-211ENST00000485349 MED12Q93074 2177 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 CTAG2O75638 210 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 CLDN9O95484 217 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 CASQ1P31415 396 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 IST1P53990 364 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC7A5Q01650 507 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 DUSP8Q13202 625 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 TBCELQ5QJ74 424 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 GALNT12Q8IXK2 581 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 PRR22Q8IZ63 422 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 TNIP2Q8NFZ5 429 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 VPS11Q9H270 941 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF358Q9NW07 568 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 DOCK7Q96N67 2140 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD33BA6NCL7 494 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 HSPB2A8KAH6 182 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 TP53I11O14683 189 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 SEMA3DO95025 777 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 BMP5P22003 454 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 PIK3R1P27986 724 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 TYK2P29597 1187 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 UQCRC1P31930 480 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 FUT7Q11130 342 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 HSPB2Q16082 182 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 FNDC7Q5VTL7 733 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM198Q66K66 360 aa15.5■□□□□ 0.07
SKIV2L-211ENST00000485349 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms