RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 POU4F1Q01851 419 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 EIPR1Q53HC9 387 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 Q5PR19 223 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 DCST1Q5T197 706 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PACS2Q86VP3 889 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 P3H2Q8IVL5 708 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PDPRQ8NCN5 879 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TANKQ92844 425 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RIT1Q92963 219 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RGMAQ96B86 450 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ALG9Q9H6U8 611 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SNX15Q9NRS6 342 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OPTCQ9UBM4 332 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 C15orf41Q9Y2V0 281 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.43□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SH3D21A4FU49 640 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OR6C76A6NM76 312 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CES2O00748 559 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 C1QAP02745 245 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 HEXAP06865 529 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CYP4B1P13584 511 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 EPB42P16452 691 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 STMN1P16949 149 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 BMP7P18075 431 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 EPORP19235 508 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PCSK6P29122 969 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SERPINB1P30740 379 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SSTR4P31391 388 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NRG3P56975 720 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SLC37A1P57057 533 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ATP6V0D1P61421 351 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 DR1Q01658 176 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SRYQ05066 204 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 BIKQ13323 160 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SLMAPQ14BN4 828 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SETDB1Q15047 1291 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TBCCQ15814 346 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NNATQ16517 81 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RAPH1Q70E73 1250 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OR7G3Q8NG95 312 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 HUS1BQ8NHY5 278 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CDKL2Q92772 493 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GNRHR2Q96P88 292 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CD244Q9BZW8 370 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 WDR41Q9HAD4 459 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GALNT8Q9NY28 637 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 DSCAMO60469 2012 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 HEATR5AQ86XA9 2040 aa9.42□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CD8B2A6NJW9 211 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 UBXN8O00124 270 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PLPP1O14494 284 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CASKO14936 926 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ARHGEF9O43307 516 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SMPD2O60906 423 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SNX4O95219 450 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GOSR1O95249 250 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GPR75O95800 540 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 AIFM1O95831 613 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 HRGP04196 525 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 HPNP05981 417 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CD53P19397 219 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 IVDP26440 423 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 HOXC12P31275 282 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GMPRP36959 345 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CASP2P42575 452 aa9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms