RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 NINQ8N4C6 2090 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6C76A6NM76 312 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 UGDHO60701 494 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ZWINTO95229 277 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 CLDN9O95484 217 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC35E2P0CK97 266 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 TYK2P29597 1187 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ARFIP1P53367 373 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 DLX5P56178 289 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 CES4AQ5XG92 561 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 BICRALQ6AI39 1079 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT13Q86X67 352 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 TAGAPQ8N103 731 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 LIX1Q8N485 282 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 L3MBTL4Q8NA19 623 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 NRGNQ92686 78 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 DIO2Q92813 273 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 DOHHQ9BU89 302 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR41Q9HAD4 459 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF358Q9NW07 568 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 HCFC1P51610 2035 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-206ENST00000446904 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC189A1A4V9 331 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 OR7A17O14581 309 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 TP53I11O14683 189 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAPPC6AO75865 159 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 KLK1P06870 262 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 CT62P0C5K7 136 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 GABRA1P14867 456 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 GDF1P27539 372 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 PIK3R1P27986 724 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 GALNSP34059 522 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 CCNG1P51959 295 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXW4P57775 412 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 NTRK2Q16620 822 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 SGO1Q5FBB7 561 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 FRG2Q64ET8 278 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 ARSKQ6UWY0 536 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 PHF21BQ96EK2 531 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 FRG2BQ96QU4 278 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 SERPINI1Q99574 410 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 SEMA3DO95025 777 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 CPMP14384 443 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 NT5EP21589 574 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 UQCRC1P31930 480 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 PHBP35232 272 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 XKP51811 444 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 ART1P52961 327 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 WNT3P56703 355 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 DUSP8Q13202 625 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS6KA2Q15349 733 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM198Q66K66 360 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-206ENST00000446904 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms