RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PRORSD1PA6NEY8 169 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF726A6NNF4 738 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 H7C4K7 107 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SCDO00767 359 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RAB36O95755 333 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NR3C1P04150 777 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CEBPBP17676 345 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TYMPP19971 482 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CHRNA4P43681 627 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TGFB2P61812 414 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TLE3Q04726 772 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 AKR1C1Q04828 323 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CBFBQ13951 182 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NFATC4Q14934 902 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ACER2Q5QJU3 275 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 C9orf64Q5T6V5 341 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR2T2Q6IF00 324 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CGB2Q6NT52 195 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 IRF2BP1Q8IU81 584 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 BVESQ8NE79 360 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MCHR2Q969V1 340 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GGACTQ9BVM4 153 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 HSD3B7Q9H2F3 369 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 HRH4Q9H3N8 390 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MMACHCQ9Y4U1 282 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PTCH1Q13635 1447 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 C7orf72A4D263 438 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 F8VP50 259 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GOSR2O14653 212 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PSMD10O75832 226 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINA7P05543 415 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ACPPP15309 386 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SPNP16150 400 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 HSD11B1P28845 292 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CMPK1P30085 196 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CDK6Q00534 326 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 HFEQ30201 348 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ACSM5Q6NUN0 579 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SLC39A4Q6P5W5 647 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FAM151BQ6UXP7 276 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GHDCQ8N2G8 530 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR10W1Q8NGF6 305 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TBCKQ8TEA7 893 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHB18PQ96TA0 734 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CENPMQ9NSP4 180 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 AIG1Q9NVV5 245 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NRCAMQ92823 1304 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CROCCQ5TZA2 2017 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 A0A096LPK6 155 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0D9SG52 128 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ALDH1A1P00352 501 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ITGB2P05107 769 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ADH5P11766 374 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PTPN3P26045 913 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ARL2P36404 184 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GLUD2P49448 558 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RAP1AP62834 184 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TNK1Q13470 666 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GTF2H2Q13888 395 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 UPP1Q16831 310 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO27Q8NI29 283 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RLN3Q8WXF3 142 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MALSU1Q96EH3 234 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 DTD2Q96FN9 168 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms