RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CD83Q01151 205 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SLC18A2Q05940 514 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 MOGQ16653 247 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM16LQ309B1 348 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC58Q4VC31 144 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SPNS3Q6ZMD2 512 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 FJX1Q86VR8 437 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 FBXW8Q8N3Y1 598 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PLPP5Q8NEB5 264 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 MAGED4Q96JG8 741 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC138Q96M89 665 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 GPR137Q96N19 417 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 RBBP8Q99708 897 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PKP2Q99959 881 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 DPH7Q9BTV6 452 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PLAGL1Q9UM63 463 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 MASP2O00187 686 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CCL21O00585 134 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 MYO1DO94832 1006 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SNX4O95219 450 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CLDN14O95500 239 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ESRRBO95718 433 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 C8BP07358 591 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PRSS56P0CW18 603 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PCNAP12004 261 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF3P17036 446 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PRKACBP22694 351 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PNLIPRP1P54315 467 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TAS2R50P59544 299 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 BST1Q10588 318 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM211Q6ICI0 200 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SH2D5Q6ZV89 423 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 GPR141Q7Z602 305 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 VRK3Q8IV63 474 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D19Q8N5T2 526 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SLC5A8Q8N695 610 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 AMER3Q8N944 861 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC120Q96HB5 630 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 OR2A5Q96R48 311 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 RHOJQ9H4E5 214 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 PALMDQ9NP74 551 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-204ENST00000440835 E9PLN8 166 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 SLC16A5O15375 505 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 PIP5K1CO60331 668 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 KRT75O95678 551 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 WDPCPO95876 746 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 CD1EP15812 388 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 NMBRP28336 390 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 TYK2P29597 1187 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 NR4A2P43354 598 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 HAAOP46952 286 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 TPTEP56180 551 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 MAPRE2Q15555 327 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 NRF1Q16656 503 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 ZBED5Q49AG3 693 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF766Q5HY98 468 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 CEP78Q5JTW2 689 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 ATG16L1Q676U5 607 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 FRMPD2BQ6IN97 320 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 UGT3A1Q6NUS8 523 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 GALNT7Q86SF2 657 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 CARM1Q86X55 608 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 GHDCQ8N2G8 530 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 CLIP4Q8N3C7 705 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRR-204ENST00000440835 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms