RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLMPQ9H6B4 373 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRPEL1Q9HAV7 217 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TREX1Q9NSU2 369 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFAF4Q9P032 175 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTSFQ9UBX1 484 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PADI1Q9ULC6 663 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCKAP5O14513 1909 aa4.21□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0J9YVX5 310 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTAGE9A4FU28 777 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TARM1B6A8C7 271 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 C21orf140B9A014 251 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MKRN2OSH3BPM6 223 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 H7C1Q1 480 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLIC1O00299 241 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF5CO60282 957 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT38O76015 456 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MT-ND3P03897 115 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TK1P04183 234 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPN2P04844 631 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 FREM3P0C091 2139 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MATN1P21941 496 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACADLP28330 430 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUSP1P28562 367 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPN4P29074 926 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RORAP35398 523 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 UQCRFS1P47985 274 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD151P48509 253 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB28P51157 221 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL11P51671 97 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGGT1BP53609 377 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACVR1Q04771 509 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPA4Q13156 261 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R7Q15435 360 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNG2Q16589 344 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 NADK2Q4G0N4 442 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLIPQ5VWP3 458 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUSD1Q6UWL2 747 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADCK2Q7Z695 626 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYVN1Q86TM6 617 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D21Q8IYX1 336 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB2Q8N680 514 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASZ1Q8WWH4 475 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 LPGAT1Q92604 370 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SARAFQ96BY9 339 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP36Q96G28 342 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINB12Q96P63 405 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PANX3Q96QZ0 392 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SELENOSQ9BQE4 189 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM51Q9BSJ1 452 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A23Q9BV35 468 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM31Q9BZY9 425 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL22Q9GZX6 179 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 P2RY12Q9H244 342 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADNPQ9H2P0 1102 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHODLQ9H9P2 273 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 BFARQ9NZS9 450 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALPQ9UBC7 116 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHMP2BQ9UQN3 213 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RCE1Q9Y256 329 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM169AQ9Y6X4 670 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.19□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTF3C1Q12789 2109 aa4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms