RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIT1Q92963 219 aa12.07□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMP4Q99727 224 aa12.07□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPNE1Q99829 537 aa12.07□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBQLN3Q9H347 655 aa12.07□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALG9Q9H6U8 611 aa12.07□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPTCQ9UBM4 332 aa12.07□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRE2Q9UHX3 823 aa12.07□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IKBKGQ9Y6K9 419 aa12.07□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFCAB8A8MWE9 144 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUPT3HB4E1H0 165 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUPT3HO75486 399 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAPPC6AO75865 159 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR75O95800 540 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPNP05981 417 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPXP11678 715 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSTR1P30872 391 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GMPRP36959 345 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GP5P40197 560 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL21P46778 160 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK9P50750 372 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARFIP1P53367 373 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB10P61026 200 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SORDQ00796 357 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBLBQ13191 982 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NHSL2Q5HYW2 709 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BICRALQ6AI39 1079 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF18BQ86Y91 864 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WFDC11Q8NEX6 87 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAG3L4Q8TBR4 150 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RILPQ96NA2 401 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMK2AQ9UQM7 478 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C15orf41Q9Y2V0 281 aa12.06□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD8B2A6NJW9 211 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPN14A8MX76 684 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBXN8O00124 270 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KERAO60938 352 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOSR1O95249 250 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR2F6P10588 404 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPB42P16452 691 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNSP34059 522 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIK3CBP42338 1070 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MASP1P48740 699 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMED10P49755 219 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXW4P57775 412 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS13P62277 151 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VASNQ6EMK4 673 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM64Q6YI46 380 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISCA2Q86U28 154 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIVMQ86UB2 503 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPPL2AQ8TCT8 520 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYROXD1Q8WU10 500 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIB1Q96RU8 372 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATOH8Q96SQ7 321 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX15Q9NRS6 342 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A5Q9Y345 797 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASB4Q9Y574 426 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOCK7Q96N67 2140 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPDZO75970 2070 aa12.05□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0A6YYD5 115 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLOD5A6NK44 160 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASHC1A8K0Z3 465 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC188H7C350 402 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR37O15354 613 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN12O43309 604 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMPRSS11DO60235 418 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEDO75530 441 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX4O95219 450 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSL3O95573 720 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AIFM1O95831 613 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35E2BP0CK96 405 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35E2P0CK97 266 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTSSP25774 331 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSTR4P31391 388 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPRM1P35372 400 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHEXP78562 749 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LTBQ06643 244 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLG1Q12959 904 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCST1Q5T197 706 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FNDC7Q5VTL7 733 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PACS2Q86VP3 889 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CREG2Q8IUH2 290 aa12.04□□□□□ -0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01560Q8TB33 94 aa12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms